Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A3Q9BRY0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC39A3Q9BRY0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A3Q9BRY0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A3Q9BRY0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms