Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6BQ99941 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6BQ99941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6BQ99941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF6BQ99941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms