Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z419

RNF144B, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144BQ7Z419 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF144BQ7Z419 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF144BQ7Z419 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144BQ7Z419 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144BQ7Z419 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms