Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L3Q6VB84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD4L3Q6VB84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L3Q6VB84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L3Q6VB84 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD4L3Q6VB84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms