Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2CLQ60I27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CLQ60I27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2CLQ60I27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CLQ60I27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CLQ60I27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CLQ60I27 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms