Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM1Q15629 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAM1Q15629 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAM1Q15629 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAM1Q15629 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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