Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CDK13Q14004 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CDK13Q14004 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CDK13Q14004 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
CDK13Q14004 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
CDK13Q14004 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CDK13Q14004 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CDK13Q14004 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CDK13Q14004 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CDK13Q14004 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CDK13Q14004 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
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