Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC38A11Q08AI6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC38A11Q08AI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC38A11Q08AI6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A11Q08AI6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms