Protein–RNA interactions for Protein: Q06102

YTH1, mRNA 3'-end-processing protein YTH1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTH1Q06102 YMR209CYMR209C 1374 nt7.18□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 LYS20YDL182W 1287 nt7.17□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 SWM1YDR260C 513 nt7.17□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 YLR173WYLR173W 1827 nt7.16□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 MOB1YIL106W 945 nt7.16□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 YKL133CYKL133C 1392 nt7.16□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 RTG2YGL252C 1767 nt7.15□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 MET1YKR069W 1782 nt7.15□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 CYC3YAL039C 810 nt7.15□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 YKR012CYKR012C 378 nt7.15□□□□□ -1.26
YTH1Q06102 NAM8YHR086W 1572 nt7.15□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 MCM5YLR274W 2328 nt7.15□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 YMR265CYMR265C 1386 nt7.14□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 SER2YGR208W 930 nt7.13□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 HAP5YOR358W 729 nt7.13□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 VMA11YPL234C 495 nt7.13□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 SSL2YIL143C 2532 nt7.13□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 CRC1YOR100C 984 nt7.12□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 SDS24YBR214W 1584 nt7.12□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 YKL053WYKL053W 375 nt7.11□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 YOR072WYOR072W 315 nt7.11□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 VBA3YCL069W 1377 nt7.09□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 CYT1YOR065W 930 nt7.09□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 snR31snR31 225 nt7.09□□□□□ -1.27
YTH1Q06102 THI6YPL214C 1623 nt7.09□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 HTS1YPR033C 1641 nt7.09□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 ENO1YGR254W 1314 nt7.08□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 REX2YLR059C 810 nt7.08□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 YMR007WYMR007W 381 nt7.08□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 SAN1YDR143C 1833 nt7.08□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 PSD1YNL169C 1503 nt7.07□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 RPN14YGL004C 1254 nt7.07□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 CWP2YKL096W-A 279 nt7.07□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 SRP102YKL154W 735 nt7.07□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 RIM2YBR192W 1134 nt7.07□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 POP2YNR052C 1302 nt7.06□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.06□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 SNX3YOR357C 489 nt7.06□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 MAS1YLR163C 1389 nt7.06□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 SRP54YPR088C 1626 nt7.05□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 RPD3YNL330C 1302 nt7.05□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 YLR280CYLR280C 351 nt7.05□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 ODC1YPL134C 933 nt7.05□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 ERO1YML130C 1692 nt7.04□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 HIS2YFR025C 1008 nt7.04□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 YGR210CYGR210C 1236 nt7.04□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 RCR1YBR005W 642 nt7.04□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 KGD2YDR148C 1392 nt7.03□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 DPL1YDR294C 1770 nt7.03□□□□□ -1.28
YTH1Q06102 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.02□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.02□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.02□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.02□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.02□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 MDL2YPL270W 2322 nt7.01□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 ADE2YOR128C 1716 nt7.01□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 YFR020WYFR020W 699 nt7□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 RPC31YNL151C 756 nt7□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 YPT11YNL304W 1254 nt7□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 GCD11YER025W 1584 nt6.99□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 LPD1YFL018C 1500 nt6.98□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 FCY1YPR062W 477 nt6.98□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 BUD20YLR074C 501 nt6.97□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 YPL108WYPL108W 507 nt6.97□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 SNU66YOR308C 1764 nt6.97□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 ALR1YOL130W 2580 nt6.97□□□□□ -1.29
YTH1Q06102 KRR1YCL059C 951 nt6.96□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 GNP1YDR508C 1992 nt6.95□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 GAS1YMR307W 1680 nt6.94□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 SBP1YHL034C 885 nt6.94□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 MEX67YPL169C 1800 nt6.94□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 THI3YDL080C 1830 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 YJL160CYJL160C 864 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 MDM35YKL053C-A 261 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 PTC6YCR079W 1329 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.93□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 RSM7YJR113C 744 nt6.92□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 PAU21YOR394W 495 nt6.92□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 PAU22YPL282C 495 nt6.92□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 EMC3YKL207W 762 nt6.91□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 MAM3YOL060C 2121 nt6.9□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 YOR343CYOR343C 327 nt6.9□□□□□ -1.3
YTH1Q06102 DUR3YHL016C 2208 nt6.89□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 GRH1YDR517W 1119 nt6.89□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 UFD1YGR048W 1086 nt6.89□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 YMR166CYMR166C 1107 nt6.89□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 LSP1YPL004C 1026 nt6.89□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 YMR210WYMR210W 1350 nt6.89□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 LEU4YNL104C 1860 nt6.88□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 ECM10YEL030W 1935 nt6.88□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 PET18YCR020C 648 nt6.87□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 HRA1HRA1 564 nt6.87□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.86□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.86□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 GPM1YKL152C 744 nt6.86□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 GGA2YHR108W 1758 nt6.86□□□□□ -1.31
YTH1Q06102 YLR460CYLR460C 1131 nt6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.3 ms