Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 SAM50YNL026W 1455 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 ODC1YPL134C 933 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 MET30YIL046W 1923 nt8.13□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 THP3YPR045C 1413 nt8.13□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 YLR046CYLR046C 813 nt8.12□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 ERG6YML008C 1152 nt8.12□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 AMF1YOR378W 1548 nt8.12□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 MRS6YOR370C 1812 nt8.12□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 YKL133CYKL133C 1392 nt8.11□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 FLX1YIL134W 936 nt8.11□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 SSL2YIL143C 2532 nt8.1□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 YNR064CYNR064C 873 nt8.1□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 NDE1YMR145C 1683 nt8.1□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 FIT1YDR534C 1587 nt8.1□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 TPC1YGR096W 945 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 NAS2YIL007C 663 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 MOB1YIL106W 945 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 OPI3YJR073C 621 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 CYC3YAL039C 810 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 RCR1YBR005W 642 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 LEU2YCL018W 1095 nt8.09□□□□□ -1.11
RRN11Q04712 YRF1-2YER190W 5046 nt8.07□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 YHR219WYHR219W 1875 nt8.06□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 STF1YDL130W-A 261 nt8.06□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 YKR012CYKR012C 378 nt8.06□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 YMR007WYMR007W 381 nt8.06□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 YHR218WYHR218W 1812 nt8.06□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 ADH3YMR083W 1128 nt8.05□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 YNL190WYNL190W 615 nt8.05□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 YDR306CYDR306C 1437 nt8.04□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 MDM35YKL053C-A 261 nt8.04□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 CWP2YKL096W-A 279 nt8.04□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 BEM1YBR200W 1656 nt8.04□□□□□ -1.12
RRN11Q04712 DLD3YEL071W 1491 nt8.02□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 HTS1YPR033C 1641 nt8.02□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 POP2YNR052C 1302 nt8.02□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 KEL3YPL263C 1956 nt8.01□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 LYS20YDL182W 1287 nt8.01□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 SER2YGR208W 930 nt8.01□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 snR31snR31 225 nt8.01□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 ENO1YGR254W 1314 nt8.01□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 PHB2YGR231C 933 nt8□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 CDD1YLR245C 429 nt8□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 RPD3YNL330C 1302 nt8□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 SAC7YDR389W 1965 nt7.99□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 NAM8YHR086W 1572 nt7.99□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 GUT1YHL032C 2130 nt7.99□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 FRT1YOR324C 1809 nt7.99□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 ELO1YJL196C 933 nt7.98□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 LSR1LSR1 1175 nt7.98□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 CCR4YAL021C 2514 nt7.98□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 HXT10YFL011W 1641 nt7.97□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 RPN14YGL004C 1254 nt7.97□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 LAS17YOR181W 1902 nt7.96□□□□□ -1.13
RRN11Q04712 SWM1YDR260C 513 nt7.96□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 SRP102YKL154W 735 nt7.96□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 YJL045WYJL045W 1905 nt7.95□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 REX2YLR059C 810 nt7.94□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 FCY1YPR062W 477 nt7.94□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 SDS24YBR214W 1584 nt7.93□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.93□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 YLR280CYLR280C 351 nt7.93□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 VMA11YPL234C 495 nt7.93□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 RIM2YBR192W 1134 nt7.93□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 ITR2YOL103W 1830 nt7.93□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 SWT21YNL187W 1074 nt7.92□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 HAP5YOR358W 729 nt7.92□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 PMA2YPL036W 2844 nt7.92□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 GGC1YDL198C 903 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 ERO1YML130C 1692 nt7.91□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 CTF3YLR381W 2202 nt7.9□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 YMR265CYMR265C 1386 nt7.9□□□□□ -1.14
RRN11Q04712 SRP54YPR088C 1626 nt7.89□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 KRR1YCL059C 951 nt7.89□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 YGR210CYGR210C 1236 nt7.89□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 BUD20YLR074C 501 nt7.89□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 YPT11YNL304W 1254 nt7.89□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 AGP3YFL055W 1677 nt7.89□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 RPC31YNL151C 756 nt7.88□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 RSM7YJR113C 744 nt7.87□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 MET1YKR069W 1782 nt7.87□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 VBA3YCL069W 1377 nt7.86□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 SNX3YOR357C 489 nt7.86□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 CMK2YOL016C 1344 nt7.85□□□□□ -1.15
RRN11Q04712 NBA1YOL070C 1506 nt7.83□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 INH1YDL181W 258 nt7.83□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 YKL053WYKL053W 375 nt7.83□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 DPL1YDR294C 1770 nt7.82□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 CRC1YOR100C 984 nt7.82□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 SUV3YPL029W 2214 nt7.81□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 MIM1YOL026C 342 nt7.81□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 YPL108WYPL108W 507 nt7.81□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 HRA1HRA1 564 nt7.8□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 GRH1YDR517W 1119 nt7.79□□□□□ -1.16
RRN11Q04712 YLR460CYLR460C 1131 nt7.79□□□□□ -1.16
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