Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 OYE2YHR179W 1203 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 FUN14YAL008W 597 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 PRY1YJL079C 900 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 ATP10YLR393W 840 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 YBL095WYBL095W 813 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 ADH1YOL086C 1047 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 HAP5YOR358W 729 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 PRC1YMR297W 1599 nt8.01□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 NAS6YGR232W 687 nt8□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 YLR349WYLR349W 507 nt8□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 YMR210WYMR210W 1350 nt7.99□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 STE4YOR212W 1272 nt7.99□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 CTF3YLR381W 2202 nt7.99□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 YLR173WYLR173W 1827 nt7.99□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 YPI1YFR003C 468 nt7.98□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 YJL195CYJL195C 702 nt7.98□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 SMM1YNR015W 1155 nt7.98□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 MET8YBR213W 825 nt7.98□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 SAM3YPL274W 1764 nt7.97□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 NDE1YMR145C 1683 nt7.96□□□□□ -1.13
CIK1Q01649 GPM1YKL152C 744 nt7.96□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 YNR029CYNR029C 1290 nt7.96□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 RPT5YOR117W 1305 nt7.96□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 AAT1YKL106W 1356 nt7.96□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 SUV3YPL029W 2214 nt7.95□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ELO1YJL196C 933 nt7.95□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 SPE4YLR146C 903 nt7.95□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 RRT8YOL048C 1029 nt7.95□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 BEM1YBR200W 1656 nt7.95□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 SNU66YOR308C 1764 nt7.94□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 YNR064CYNR064C 873 nt7.94□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ECM10YEL030W 1935 nt7.93□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 PMT7YDR307W 1989 nt7.93□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 YLR072WYLR072W 2082 nt7.93□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ERG6YML008C 1152 nt7.93□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.93□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 KEL3YPL263C 1956 nt7.92□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 YMC2YBR104W 990 nt7.92□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 GCD11YER025W 1584 nt7.92□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.91□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 PAB1YER165W 1734 nt7.9□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ERR3YMR323W 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ERR1YOR393W 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 ERR2YPL281C 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 YPL264CYPL264C 1062 nt7.9□□□□□ -1.14
CIK1Q01649 TPS1YBR126C 1488 nt7.89□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 DDI1YER143W 1287 nt7.89□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 YJL118WYJL118W 660 nt7.89□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 MGM101YJR144W 810 nt7.89□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 snR31snR31 225 nt7.89□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 MLS1YNL117W 1665 nt7.89□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 YEL008WYEL008W 381 nt7.88□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 YMR253CYMR253C 1245 nt7.88□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 TMA23YMR269W 636 nt7.87□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 VRG4YGL225W 1014 nt7.86□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 CBK1YNL161W 2271 nt7.86□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 ADH7YCR105W 1086 nt7.85□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 YJR114WYJR114W 393 nt7.85□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 LEA1YPL213W 717 nt7.85□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 ADE2YOR128C 1716 nt7.85□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 YIL108WYIL108W 2091 nt7.84□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 PAU15YIR041W 375 nt7.84□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 CRC1YOR100C 984 nt7.84□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 THI3YDL080C 1830 nt7.84□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 GGA2YHR108W 1758 nt7.84□□□□□ -1.15
CIK1Q01649 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.83□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 IMO32YGR031W 1029 nt7.83□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 YJL055WYJL055W 738 nt7.83□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 ATO2YNR002C 849 nt7.83□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 MRS4YKR052C 915 nt7.82□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 RIB7YBR153W 735 nt7.82□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 AFG2YLR397C 2343 nt7.81□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 AQR1YNL065W 1761 nt7.81□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 RIB2YOL066C 1776 nt7.81□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 ADE8YDR408C 645 nt7.8□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.8□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 YNL040WYNL040W 1371 nt7.8□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 HXT9YJL219W 1704 nt7.8□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 YER152CYER152C 1332 nt7.79□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 CPD1YGR247W 720 nt7.79□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 YJL045WYJL045W 1905 nt7.79□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 MAS2YHR024C 1449 nt7.78□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 SAM50YNL026W 1455 nt7.78□□□□□ -1.16
CIK1Q01649 YHR131CYHR131C 2553 nt7.77□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 MET1YKR069W 1782 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 GAL3YDR009W 1563 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 KGD2YDR148C 1392 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 snR86snR86 1004 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 OPI3YJR073C 621 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 SWT21YNL187W 1074 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 POB3YML069W 1659 nt7.76□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 ESS1YJR017C 513 nt7.75□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 HXT13YEL069C 1695 nt7.75□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 ABP1YCR088W 1779 nt7.74□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 RRT6YGL146C 936 nt7.74□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 SBP1YHL034C 885 nt7.74□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 CCR4YAL021C 2514 nt7.72□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 ECM27YJR106W 2178 nt7.72□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 HIS3YOR202W 663 nt7.72□□□□□ -1.17
CIK1Q01649 WSC4YHL028W 1818 nt7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms