Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P62891 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P62891 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P62891 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P62891 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P62891 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P62891 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL39P62891 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P62891 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P62891 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL39P62891 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P62891 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P62891 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL39P62891 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P62891 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P62891 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL39P62891 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P62891 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P62891 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL39P62891 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P62891 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P62891 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL39P62891 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P62891 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P62891 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P62891 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P62891 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL39P62891 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P62891 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P62891 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P62891 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P62891 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL39P62891 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P62891 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL39P62891 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL39P62891 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P62891 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P62891 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL39P62891 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P62891 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P62891 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL39P62891 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P62891 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P62891 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P62891 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL39P62891 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P62891 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P62891 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P62891 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P62891 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL39P62891 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P62891 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P62891 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P62891 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P62891 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P62891 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL39P62891 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL39P62891 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P62891 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P62891 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P62891 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL39P62891 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P62891 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P62891 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P62891 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL39P62891 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL39P62891 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P62891 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P62891 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P62891 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P62891 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P62891 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL39P62891 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms