Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEFSECP57772 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EEFSECP57772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEFSECP57772 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEFSECP57772 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEFSECP57772 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.8 ms