Protein–RNA interactions for Protein: P48016

ATH1, Vacuolar acid trehalase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATH1P48016 MED2YDL005C 1296 nt10.34□□□□□ -0.75
ATH1P48016 RPN9YDR427W 1182 nt10.34□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YFL054CYFL054C 1941 nt10.34□□□□□ -0.75
ATH1P48016 TCA17YEL048C 459 nt10.33□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YLH47YPR125W 1365 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 RPC53YDL150W 1269 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 ERJ5YFR041C 888 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 CCE1YKL011C 1062 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YLR118CYLR118C 684 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YOL079WYOL079W 399 nt10.32□□□□□ -0.76
ATH1P48016 ESC2YDR363W 1371 nt10.31□□□□□ -0.76
ATH1P48016 OAC1YKL120W 975 nt10.31□□□□□ -0.76
ATH1P48016 TAP42YMR028W 1101 nt10.31□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YPR027CYPR027C 834 nt10.31□□□□□ -0.76
ATH1P48016 VAC17YCL063W 1272 nt10.3□□□□□ -0.76
ATH1P48016 ARG3YJL088W 1017 nt10.3□□□□□ -0.76
ATH1P48016 FIP1YJR093C 984 nt10.3□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YAP6YDR259C 1152 nt10.29□□□□□ -0.76
ATH1P48016 OKP1YGR179C 1221 nt10.29□□□□□ -0.76
ATH1P48016 SLZ1YNL196C 897 nt10.29□□□□□ -0.76
ATH1P48016 COQ2YNR041C 1119 nt10.29□□□□□ -0.76
ATH1P48016 BAG7YOR134W 1230 nt10.29□□□□□ -0.76
ATH1P48016 ATG22YCL038C 1587 nt10.28□□□□□ -0.76
ATH1P48016 RAD51YER095W 1203 nt10.28□□□□□ -0.76
ATH1P48016 RRT6YGL146C 936 nt10.28□□□□□ -0.76
ATH1P48016 YLR407WYLR407W 687 nt10.28□□□□□ -0.76
ATH1P48016 SDH5YOL071W 489 nt10.28□□□□□ -0.76
ATH1P48016 TDH1YJL052W 999 nt10.27□□□□□ -0.77
ATH1P48016 POP5YAL033W 522 nt10.27□□□□□ -0.77
ATH1P48016 COG5YNL051W 1212 nt10.27□□□□□ -0.77
ATH1P48016 NMT1YLR195C 1368 nt10.26□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YDR220CYDR220C 294 nt10.26□□□□□ -0.77
ATH1P48016 ISY1YJR050W 708 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YJR115WYJR115W 510 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 IBD2YNL164C 1056 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 RTC4YNL254C 1206 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 RPN8YOR261C 1017 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 PTC4YBR125C 1182 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 MIC12YBR262C 321 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 KAR1YNL188W 1302 nt10.25□□□□□ -0.77
ATH1P48016 COG7YGL005C 840 nt10.24□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YGR201CYGR201C 678 nt10.24□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YJR096WYJR096W 849 nt10.24□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YLR202CYLR202C 327 nt10.24□□□□□ -0.77
ATH1P48016 IPI3YNL182C 1668 nt10.23□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YFL019CYFL019C 354 nt10.23□□□□□ -0.77
ATH1P48016 DCI1YOR180C 816 nt10.23□□□□□ -0.77
ATH1P48016 HHO1YPL127C 777 nt10.23□□□□□ -0.77
ATH1P48016 RPL4BYDR012W 1089 nt10.22□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YFR045WYFR045W 930 nt10.22□□□□□ -0.77
ATH1P48016 STE4YOR212W 1272 nt10.22□□□□□ -0.77
ATH1P48016 RPL4AYBR031W 1089 nt10.22□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YCR025CYCR025C 411 nt10.21□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YNL226WYNL226W 411 nt10.21□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YNR029CYNR029C 1290 nt10.21□□□□□ -0.77
ATH1P48016 YNR048WYNR048W 1182 nt10.21□□□□□ -0.77
ATH1P48016 AVT6YER119C 1347 nt10.21□□□□□ -0.78
ATH1P48016 SAS4YDR181C 1446 nt10.21□□□□□ -0.78
ATH1P48016 HSP60YLR259C 1719 nt10.21□□□□□ -0.78
ATH1P48016 snR56snR56 88 nt10.2□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.2□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YIP3YNL044W 531 nt10.2□□□□□ -0.78
ATH1P48016 SET6YPL165C 1122 nt10.2□□□□□ -0.78
ATH1P48016 TIF5YPR041W 1218 nt10.2□□□□□ -0.78
ATH1P48016 RAX1YOR301W 1308 nt10.19□□□□□ -0.78
ATH1P48016 PPH22YDL188C 1134 nt10.19□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YDR161WYDR161W 1164 nt10.19□□□□□ -0.78
ATH1P48016 RAD23YEL037C 1197 nt10.19□□□□□ -0.78
ATH1P48016 DDI1YER143W 1287 nt10.19□□□□□ -0.78
ATH1P48016 ALG12YNR030W 1656 nt10.18□□□□□ -0.78
ATH1P48016 MMS2YGL087C 414 nt10.18□□□□□ -0.78
ATH1P48016 ATP12YJL180C 978 nt10.18□□□□□ -0.78
ATH1P48016 CTR3YLR411W 726 nt10.18□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YNL171CYNL171C 369 nt10.18□□□□□ -0.78
ATH1P48016 MTG1YMR097C 1104 nt10.17□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YOL024WYOL024W 519 nt10.17□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YMR209CYMR209C 1374 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 SFA1YDL168W 1161 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 CWC15YDR163W 528 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 SPC42YKL042W 1092 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 GOR1YNL274C 1053 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 HEM15YOR176W 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YCR102CYCR102C 1107 nt10.15□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YDL241WYDL241W 372 nt10.15□□□□□ -0.78
ATH1P48016 UFD1YGR048W 1086 nt10.15□□□□□ -0.78
ATH1P48016 SSU72YNL222W 621 nt10.15□□□□□ -0.78
ATH1P48016 YBR089WYBR089W 600 nt10.15□□□□□ -0.78
ATH1P48016 PCI8YIL071C 1335 nt10.14□□□□□ -0.79
ATH1P48016 ADH7YCR105W 1086 nt10.14□□□□□ -0.79
ATH1P48016 SRL2YLR082C 1179 nt10.14□□□□□ -0.79
ATH1P48016 TAF11YML015C 1041 nt10.14□□□□□ -0.79
ATH1P48016 GLC8YMR311C 690 nt10.14□□□□□ -0.79
ATH1P48016 snR57snR57 88 nt10.13□□□□□ -0.79
ATH1P48016 YLR349WYLR349W 507 nt10.13□□□□□ -0.79
ATH1P48016 COX11YPL132W 903 nt10.13□□□□□ -0.79
ATH1P48016 MRPL32YCR003W 552 nt10.12□□□□□ -0.79
ATH1P48016 RAM1YDL090C 1296 nt10.12□□□□□ -0.79
ATH1P48016 DCD1YHR144C 939 nt10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms