Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD52P43351 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD52P43351 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD52P43351 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD52P43351 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD52P43351 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD52P43351 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD52P43351 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD52P43351 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD52P43351 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD52P43351 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD52P43351 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD52P43351 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD52P43351 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD52P43351 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD52P43351 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD52P43351 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD52P43351 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD52P43351 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD52P43351 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD52P43351 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD52P43351 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD52P43351 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD52P43351 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD52P43351 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD52P43351 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD52P43351 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD52P43351 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD52P43351 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD52P43351 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD52P43351 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD52P43351 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD52P43351 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD52P43351 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD52P43351 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD52P43351 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD52P43351 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD52P43351 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD52P43351 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD52P43351 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD52P43351 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD52P43351 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD52P43351 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD52P43351 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD52P43351 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD52P43351 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD52P43351 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD52P43351 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD52P43351 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD52P43351 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD52P43351 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD52P43351 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD52P43351 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD52P43351 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD52P43351 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD52P43351 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD52P43351 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD52P43351 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD52P43351 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD52P43351 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD52P43351 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD52P43351 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD52P43351 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD52P43351 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD52P43351 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD52P43351 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD52P43351 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD52P43351 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD52P43351 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD52P43351 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD52P43351 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD52P43351 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD52P43351 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD52P43351 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD52P43351 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD52P43351 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD52P43351 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD52P43351 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD52P43351 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD52P43351 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD52P43351 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD52P43351 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD52P43351 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD52P43351 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD52P43351 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD52P43351 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms