Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	SAM3	YPL274W	1764 nt		7.32	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	SRM1	YGL097W	1449 nt		7.32	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YJL045W	YJL045W	1905 nt		7.32	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	TOP3	YLR234W	1971 nt		7.31	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	TPS1	YBR126C	1488 nt		7.31	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	RAD23	YEL037C	1197 nt		7.31	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	LCP5	YER127W	1074 nt		7.31	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	SMM1	YNR015W	1155 nt		7.3	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	MDH2	YOL126C	1134 nt		7.3	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YPL222C-A	YPL222C-A	246 nt		7.3	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	RPT5	YOR117W	1305 nt		7.29	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	ADE5,7	YGL234W	2409 nt		7.29	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YDR467C	YDR467C	327 nt		7.29	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	ELO1	YJL196C	933 nt		7.29	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	SAC7	YDR389W	1965 nt		7.29	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	FAF1	YIL019W	1041 nt		7.28	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YJL118W	YJL118W	660 nt		7.28	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	YLR111W	YLR111W	333 nt		7.28	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	PRC1	YMR297W	1599 nt		7.28	□□□□□ -1.24
SIP1	P32578	CHA1	YCL064C	1083 nt		7.27	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	URH1	YDR400W	1023 nt		7.27	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	ECM10	YEL030W	1935 nt		7.27	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	KDX1	YKL161C	1302 nt		7.27	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	NDE1	YMR145C	1683 nt		7.26	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	CTF3	YLR381W	2202 nt		7.26	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	ATP10	YLR393W	840 nt		7.26	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	YMR226C	YMR226C	804 nt		7.26	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	ECM27	YJR106W	2178 nt		7.26	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	GND1	YHR183W	1470 nt		7.25	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	RIB3	YDR487C	627 nt		7.25	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	YJL055W	YJL055W	738 nt		7.24	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	YMR210W	YMR210W	1350 nt		7.23	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	EMC3	YKL207W	762 nt		7.23	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	BEM1	YBR200W	1656 nt		7.22	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	YMR265C	YMR265C	1386 nt		7.22	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	PUS5	YLR165C	765 nt		7.22	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	TMA23	YMR269W	636 nt		7.22	□□□□□ -1.25
SIP1	P32578	STF1	YDL130W-A	261 nt		7.21	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	PMT7	YDR307W	1989 nt		7.2	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YHR131C	YHR131C	2553 nt		7.2	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	CAB5	YDR196C	726 nt		7.2	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YLR437C-A	YLR437C-A	228 nt		7.2	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YNR064C	YNR064C	873 nt		7.2	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	AAC3	YBR085W	924 nt		7.2	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	HAP5	YOR358W	729 nt		7.19	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	VRG4	YGL225W	1014 nt		7.18	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	LOT5	YKL183W	921 nt		7.18	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	SPE4	YLR146C	903 nt		7.18	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	AFG2	YLR397C	2343 nt		7.18	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	SUV3	YPL029W	2214 nt		7.17	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YLR072W	YLR072W	2082 nt		7.17	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	MLS1	YNL117W	1665 nt		7.17	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	GUT1	YHL032C	2130 nt		7.17	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YBL095W	YBL095W	813 nt		7.17	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	AAT1	YKL106W	1356 nt		7.17	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YIL108W	YIL108W	2091 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	ADE8	YDR408C	645 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	RPN14	YGL004C	1254 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	IDP3	YNL009W	1263 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	ERR3	YMR323W	1314 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	ERR1	YOR393W	1314 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	ERR2	YPL281C	1314 nt		7.16	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	IMO32	YGR031W	1029 nt		7.15	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	RBG2	YGR173W	1107 nt		7.15	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	ERG6	YML008C	1152 nt		7.15	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	YMR253C	YMR253C	1245 nt		7.15	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	RRT8	YOL048C	1029 nt		7.15	□□□□□ -1.26
SIP1	P32578	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		7.14	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	LSB3	YFR024C-A	1380 nt		7.14	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	FHN1	YGR131W	525 nt		7.14	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	YJR114W	YJR114W	393 nt		7.14	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	KEL3	YPL263C	1956 nt		7.14	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	GPM1	YKL152C	744 nt		7.13	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	RIB7	YBR153W	735 nt		7.13	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	GAL3	YDR009W	1563 nt		7.12	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	ATO2	YNR002C	849 nt		7.12	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	CRC1	YOR100C	984 nt		7.12	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	YMC2	YBR104W	990 nt		7.12	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	YEL034C-A	YEL034C-A	603 nt		7.11	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	OPI3	YJR073C	621 nt		7.11	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	YLR122C	YLR122C	378 nt		7.11	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	YPL264C	YPL264C	1062 nt		7.11	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	AQR1	YNL065W	1761 nt		7.1	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	ATG22	YCL038C	1587 nt		7.09	□□□□□ -1.27
SIP1	P32578	MAS2	YHR024C	1449 nt		7.09	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	ATG17	YLR423C	1254 nt		7.08	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	LEA1	YPL213W	717 nt		7.08	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	CCR4	YAL021C	2514 nt		7.08	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	MET1	YKR069W	1782 nt		7.08	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	YNL040W	YNL040W	1371 nt		7.08	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	YFR036W-A	YFR036W-A	651 nt		7.07	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	snR31	snR31	225 nt		7.07	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	HXT9	YJL219W	1704 nt		7.07	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	HXT13	YEL069C	1695 nt		7.06	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	SAM50	YNL026W	1455 nt		7.06	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	RIB2	YOL066C	1776 nt		7.06	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	YPI1	YFR003C	468 nt		7.06	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	KGD2	YDR148C	1392 nt		7.06	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	CBK1	YNL161W	2271 nt		7.06	□□□□□ -1.28
SIP1	P32578	YER152C	YER152C	1332 nt		7.05	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.2 ms