Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 PAU16YKL224C 372 nt7.14□□□□□ -1.27
MSK1P32048 LAS17YOR181W 1902 nt7.14□□□□□ -1.27
MSK1P32048 LEA1YPL213W 717 nt7.14□□□□□ -1.27
MSK1P32048 IMO32YGR031W 1029 nt7.13□□□□□ -1.27
MSK1P32048 AIM34YMR003W 597 nt7.13□□□□□ -1.27
MSK1P32048 YMR244WYMR244W 1068 nt7.13□□□□□ -1.27
MSK1P32048 SDH5YOL071W 489 nt7.13□□□□□ -1.27
MSK1P32048 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.13□□□□□ -1.27
MSK1P32048 THI3YDL080C 1830 nt7.13□□□□□ -1.27
MSK1P32048 SMM1YNR015W 1155 nt7.12□□□□□ -1.27
MSK1P32048 GGA2YHR108W 1758 nt7.12□□□□□ -1.27
MSK1P32048 MRS4YKR052C 915 nt7.11□□□□□ -1.27
MSK1P32048 ADE8YDR408C 645 nt7.09□□□□□ -1.27
MSK1P32048 KGD2YDR148C 1392 nt7.08□□□□□ -1.28
MSK1P32048 PMT7YDR307W 1989 nt7.08□□□□□ -1.28
MSK1P32048 YDR094WYDR094W 336 nt7.08□□□□□ -1.28
MSK1P32048 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.08□□□□□ -1.28
MSK1P32048 MET8YBR213W 825 nt7.08□□□□□ -1.28
MSK1P32048 ITR1YDR497C 1755 nt7.08□□□□□ -1.28
MSK1P32048 ESS1YJR017C 513 nt7.07□□□□□ -1.28
MSK1P32048 OPI3YJR073C 621 nt7.07□□□□□ -1.28
MSK1P32048 RIB7YBR153W 735 nt7.07□□□□□ -1.28
MSK1P32048 MET1YKR069W 1782 nt7.07□□□□□ -1.28
MSK1P32048 GCD11YER025W 1584 nt7.07□□□□□ -1.28
MSK1P32048 snR86snR86 1004 nt7.06□□□□□ -1.28
MSK1P32048 PRC1YMR297W 1599 nt7.05□□□□□ -1.28
MSK1P32048 SWT21YNL187W 1074 nt7.05□□□□□ -1.28
MSK1P32048 AAC3YBR085W 924 nt7.04□□□□□ -1.28
MSK1P32048 ABP1YCR088W 1779 nt7.04□□□□□ -1.28
MSK1P32048 YJL055WYJL055W 738 nt7.03□□□□□ -1.28
MSK1P32048 CHA1YCL064C 1083 nt7.02□□□□□ -1.29
MSK1P32048 NAS6YGR232W 687 nt7.02□□□□□ -1.29
MSK1P32048 SBP1YHL034C 885 nt7.02□□□□□ -1.29
MSK1P32048 TOP3YLR234W 1971 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 GAL3YDR009W 1563 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 RAD23YEL037C 1197 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 VRG4YGL225W 1014 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 ATP10YLR393W 840 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 HIS3YOR202W 663 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 YPL264CYPL264C 1062 nt7.01□□□□□ -1.29
MSK1P32048 BEM1YBR200W 1656 nt7□□□□□ -1.29
MSK1P32048 SPE4YLR146C 903 nt7□□□□□ -1.29
MSK1P32048 PAB1YER165W 1734 nt7□□□□□ -1.29
MSK1P32048 ADE2YOR128C 1716 nt6.99□□□□□ -1.29
MSK1P32048 TVP23YDR084C 600 nt6.99□□□□□ -1.29
MSK1P32048 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.99□□□□□ -1.29
MSK1P32048 NDE2YDL085W 1638 nt6.98□□□□□ -1.29
MSK1P32048 ECM10YEL030W 1935 nt6.98□□□□□ -1.29
MSK1P32048 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt6.98□□□□□ -1.29
MSK1P32048 YKL053WYKL053W 375 nt6.98□□□□□ -1.29
MSK1P32048 FRT1YOR324C 1809 nt6.98□□□□□ -1.29
MSK1P32048 LSB3YFR024C-A 1380 nt6.97□□□□□ -1.29
MSK1P32048 ERG6YML008C 1152 nt6.97□□□□□ -1.29
MSK1P32048 GGC1YDL198C 903 nt6.96□□□□□ -1.3
MSK1P32048 SAN1YDR143C 1833 nt6.95□□□□□ -1.3
MSK1P32048 RIB3YDR487C 627 nt6.95□□□□□ -1.3
MSK1P32048 HXT9YJL219W 1704 nt6.95□□□□□ -1.3
MSK1P32048 SNU66YOR308C 1764 nt6.95□□□□□ -1.3
MSK1P32048 LYS20YDL182W 1287 nt6.94□□□□□ -1.3
MSK1P32048 ERR3YMR323W 1314 nt6.94□□□□□ -1.3
MSK1P32048 ERR1YOR393W 1314 nt6.94□□□□□ -1.3
MSK1P32048 ERR2YPL281C 1314 nt6.94□□□□□ -1.3
MSK1P32048 MAM3YOL060C 2121 nt6.94□□□□□ -1.3
MSK1P32048 WSC4YHL028W 1818 nt6.93□□□□□ -1.3
MSK1P32048 YER152CYER152C 1332 nt6.93□□□□□ -1.3
MSK1P32048 TIF3YPR163C 1311 nt6.93□□□□□ -1.3
MSK1P32048 PMA2YPL036W 2844 nt6.93□□□□□ -1.3
MSK1P32048 PAR32YDL173W 888 nt6.92□□□□□ -1.3
MSK1P32048 CAB5YDR196C 726 nt6.92□□□□□ -1.3
MSK1P32048 YNL140CYNL140C 570 nt6.92□□□□□ -1.3
MSK1P32048 TMS1YDR105C 1422 nt6.92□□□□□ -1.3
MSK1P32048 CBK1YNL161W 2271 nt6.91□□□□□ -1.3
MSK1P32048 RRT6YGL146C 936 nt6.91□□□□□ -1.3
MSK1P32048 YMR253CYMR253C 1245 nt6.91□□□□□ -1.3
MSK1P32048 MLS1YNL117W 1665 nt6.9□□□□□ -1.3
MSK1P32048 AMF1YOR378W 1548 nt6.9□□□□□ -1.31
MSK1P32048 CTF3YLR381W 2202 nt6.89□□□□□ -1.31
MSK1P32048 YJL009WYJL009W 327 nt6.89□□□□□ -1.31
MSK1P32048 MET13YGL125W 1803 nt6.89□□□□□ -1.31
MSK1P32048 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.88□□□□□ -1.31
MSK1P32048 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt6.88□□□□□ -1.31
MSK1P32048 MGM101YJR144W 810 nt6.88□□□□□ -1.31
MSK1P32048 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.87□□□□□ -1.31
MSK1P32048 SPS100YHR139C 981 nt6.87□□□□□ -1.31
MSK1P32048 NDE1YMR145C 1683 nt6.87□□□□□ -1.31
MSK1P32048 SGF73YGL066W 1974 nt6.86□□□□□ -1.31
MSK1P32048 GAS1YMR307W 1680 nt6.86□□□□□ -1.31
MSK1P32048 AQR1YNL065W 1761 nt6.85□□□□□ -1.31
MSK1P32048 ENO2YHR174W 1314 nt6.85□□□□□ -1.31
MSK1P32048 GLY1YEL046C 1164 nt6.85□□□□□ -1.31
MSK1P32048 YMR226CYMR226C 804 nt6.85□□□□□ -1.31
MSK1P32048 MRN1YPL184C 1839 nt6.85□□□□□ -1.31
MSK1P32048 SAM50YNL026W 1455 nt6.85□□□□□ -1.31
MSK1P32048 INM1YHR046C 888 nt6.84□□□□□ -1.31
MSK1P32048 YBR056WYBR056W 1506 nt6.83□□□□□ -1.32
MSK1P32048 ABZ2YMR289W 1125 nt6.83□□□□□ -1.32
MSK1P32048 MEP1YGR121C 1479 nt6.83□□□□□ -1.32
MSK1P32048 YHR131CYHR131C 2553 nt6.83□□□□□ -1.32
MSK1P32048 INO1YJL153C 1602 nt6.83□□□□□ -1.32
MSK1P32048 SRP54YPR088C 1626 nt6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms