Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD3O94806 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD3O94806 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKD3O94806 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKD3O94806 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms