Protein–RNA interactions for Protein: O76038

SCGN, Secretagogin, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGNO76038 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGNO76038 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGNO76038 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGNO76038 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGNO76038 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGNO76038 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGNO76038 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGNO76038 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGNO76038 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGNO76038 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGNO76038 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGNO76038 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGNO76038 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGNO76038 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGNO76038 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGNO76038 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGNO76038 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGNO76038 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCGNO76038 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGNO76038 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGNO76038 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGNO76038 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGNO76038 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGNO76038 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGNO76038 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGNO76038 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGNO76038 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCGNO76038 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGNO76038 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGNO76038 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGNO76038 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGNO76038 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGNO76038 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGNO76038 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGNO76038 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGNO76038 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGNO76038 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGNO76038 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGNO76038 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGNO76038 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGNO76038 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGNO76038 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGNO76038 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGNO76038 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGNO76038 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGNO76038 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGNO76038 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGNO76038 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGNO76038 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCGNO76038 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGNO76038 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGNO76038 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGNO76038 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGNO76038 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCGNO76038 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGNO76038 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGNO76038 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGNO76038 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGNO76038 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGNO76038 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGNO76038 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGNO76038 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGNO76038 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGNO76038 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGNO76038 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGNO76038 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCGNO76038 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGNO76038 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGNO76038 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGNO76038 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGNO76038 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGNO76038 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGNO76038 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGNO76038 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGNO76038 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGNO76038 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGNO76038 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGNO76038 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGNO76038 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGNO76038 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGNO76038 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCGNO76038 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms