Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA2O75334 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA2O75334 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA2O75334 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms