Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC3O15379 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC3O15379 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC3O15379 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC3O15379 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC3O15379 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms