Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BHMG1C9JSJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BHMG1C9JSJ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BHMG1C9JSJ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BHMG1C9JSJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BHMG1C9JSJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms