Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM1B2RUZ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM1B2RUZ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM1B2RUZ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM1B2RUZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms