Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BEST4Q8NFU0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEST4Q8NFU0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms