Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC82Q8N4S0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms