Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNE4Q8N205 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE4Q8N205 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms