Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms