Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 SSN2YDR443C 4263 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 SXM1YDR395W 2835 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 CSE1YGL238W 2883 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 TUS1YLR425W 3924 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 SRB8YCR081W 4284 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 DGR1YNL130C-A 147 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 NUT1YGL151W 3399 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 IRE1YHR079C 3348 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 INO80YGL150C 4470 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 KIP1YBL063W 3336 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 SAP1YER047C 2694 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 ULP2YIL031W 3105 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 SIR4YDR227W 4077 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB19Q12502 TOP2YNL088W 4287 nt2.58□□□□□ -2
LDB19Q12502 CYR1YJL005W 6081 nt2.58□□□□□ -2
LDB19Q12502 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.58□□□□□ -2
LDB19Q12502 PDR11YIL013C 4236 nt2.58□□□□□ -2
LDB19Q12502 MSH6YDR097C 3729 nt2.57□□□□□ -2
LDB19Q12502 MSB1YOR188W 3414 nt2.57□□□□□ -2
LDB19Q12502 SEC8YPR055W 3198 nt2.56□□□□□ -2
LDB19Q12502 AMS1YGL156W 3252 nt2.56□□□□□ -2
LDB19Q12502 NUM1YDR150W 8247 nt2.55□□□□□ -2
LDB19Q12502 FLO11YIR019C 4104 nt2.55□□□□□ -2
LDB19Q12502 CAT8YMR280C 4302 nt2.55□□□□□ -2
LDB19Q12502 SEC3YER008C 4011 nt2.52□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 TOR1YJR066W 7413 nt2.52□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 PRP16YKR086W 3216 nt2.51□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 ESC1YMR219W 4977 nt2.51□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 PAU12YGR294W 363 nt2.51□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 FAR11YNL127W 2862 nt2.51□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.5□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 YSP1YHR155W 3687 nt2.5□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 KRE33YNL132W 3171 nt2.5□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 PET309YLR067C 2898 nt2.49□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 SSD1YDR293C 3753 nt2.49□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.48□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 HUG1YML058W-A 207 nt2.47□□□□□ -2.01
LDB19Q12502 HIR3YJR140C 4947 nt2.46□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 RAD50YNL250W 3939 nt2.46□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 CHC1YGL206C 4962 nt2.45□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 HSL1YKL101W 4557 nt2.45□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 BNR1YIL159W 4128 nt2.45□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 TDA9YML081W 3756 nt2.45□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 UBR1YGR184C 5853 nt2.44□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 UTP21YLR409C 2820 nt2.44□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 IRC20YLR247C 4671 nt2.44□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 STH1YIL126W 4080 nt2.44□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 KOG1YHR186C 4674 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 YMR160WYMR160W 2451 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 VPS13YLL040C 9435 nt2.42□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 GIP3YPL137C 3831 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 YLR422WYLR422W 5799 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 IRA2YOL081W 9240 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.41□□□□□ -2.02
LDB19Q12502 MSH3YCR092C 3057 nt2.39□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.38□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 UTP22YGR090W 3714 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 MSN5YDR335W 3675 nt2.37□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 CSF1YLR087C 8877 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 GEA2YEL022W 4380 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 TRA1YHR099W 11235 nt2.36□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 FYV8YGR196C 2454 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 CDC25YLR310C 4770 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 YCS4YLR272C 3531 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 SPF1YEL031W 3648 nt2.35□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB19Q12502 PSD2YGR170W 3417 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 UBP2YOR124C 3819 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 PEP1YBL017C 4740 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 KAP122YGL016W 3246 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 YOL098CYOL098C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB19Q12502 RAV1YJR033C 4074 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB19Q12502 DNF1YER166W 4716 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB19Q12502 FAB1YFR019W 6837 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB19Q12502 ATG9YDL149W 2994 nt2.25□□□□□ -2.05
LDB19Q12502 MYO4YAL029C 4416 nt2.24□□□□□ -2.05
LDB19Q12502 YLR419WYLR419W 4308 nt2.23□□□□□ -2.05
LDB19Q12502 snR67snR67 82 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 SMC4YLR086W 4257 nt2.21□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 BNI1YNL271C 5862 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 APL3YBL037W 3078 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 MLP2YIL149C 5040 nt2.2□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 HER1YOR227W 3741 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB19Q12502 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB19Q12502 NUP192YJL039C 5052 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB19Q12502 TOR2YKL203C 7425 nt2.13□□□□□ -2.07
LDB19Q12502 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB19Q12502 SEC31YDL195W 3822 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB19Q12502 UBR2YLR024C 5619 nt2.08□□□□□ -2.08
LDB19Q12502 CCH1YGR217W 6120 nt2.06□□□□□ -2.08
LDB19Q12502 BPH1YCR032W 6504 nt2.06□□□□□ -2.08
LDB19Q12502 NEO1YIL048W 3456 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB19Q12502 SKI3YPR189W 4299 nt2.05□□□□□ -2.08
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