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Protein–RNA interactions for Protein: Q12315
GLE1, Nucleoporin GLE1, yeast
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538 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
GLE1
Q12315
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.4
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YOR015W
YOR015W
360 nt
0.39
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
0.38
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YGL149W
YGL149W
306 nt
0.38
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YGR069W
YGR069W
336 nt
0.38
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YNL028W
YNL028W
318 nt
0.38
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
COY1
YKL179C
2040 nt
0.38
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YLR120W-A
YLR120W-A
102 nt
0.37
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YER097W
YER097W
330 nt
0.36
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YFL032W
YFL032W
321 nt
0.36
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
RPL39
YJL189W
156 nt
0.36
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YKL118W
YKL118W
312 nt
0.36
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YOR161W-A
YOR161W-A
81 nt
0.35
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
YPR092W
YPR092W
306 nt
0.35
□□□□□ -2.35
GLE1
Q12315
GIM4
YEL003W
336 nt
0.34
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YGL123C-A
YGL123C-A
231 nt
0.34
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YLL019W-A
YLL019W-A
93 nt
0.34
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.34
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.33
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
HMRA1
YCR097W
381 nt
0.32
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.32
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
BLI1
YKL061W
342 nt
0.32
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
0.32
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.32
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.31
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YDR413C
YDR413C
576 nt
0.3
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YMR172C-A
YMR172C-A
384 nt
0.3
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.29
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
TAH1
YCR060W
336 nt
0.29
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.29
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YHR175W-A
YHR175W-A
150 nt
0.29
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YNL146W
YNL146W
303 nt
0.29
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
YOR072W-B
YOR072W-B
162 nt
0.28
□□□□□ -2.36
GLE1
Q12315
RAD61
YDR014W
1944 nt
0.27
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
snR56
snR56
88 nt
0.27
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
COX12
YLR038C
252 nt
0.27
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.27
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
RPM2
YML091C
3609 nt
0.26
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
tR(ACG)Q2
tR(ACG)Q2
74 nt
0.25
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.25
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
PRP39
YML046W
1890 nt
0.24
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
snR74
snR74
88 nt
0.24
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
SNU13
YEL026W
381 nt
0.23
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
YGL052W
YGL052W
306 nt
0.23
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
YOR008C-A
YOR008C-A
225 nt
0.23
□□□□□ -2.37
GLE1
Q12315
YDR366C
YDR366C
399 nt
0.21
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YER053C-A
YER053C-A
114 nt
0.21
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.2
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YNL277W-A
YNL277W-A
189 nt
0.2
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YIL002W-A
YIL002W-A
210 nt
0.19
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
0.18
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YKU70
YMR284W
1809 nt
0.16
□□□□□ -2.38
GLE1
Q12315
YEL073C
YEL073C
324 nt
0.15
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
YIR030W-A
YIR030W-A
384 nt
0.15
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.15
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.15
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
YCR038W-A
YCR038W-A
126 nt
0.13
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
SOV1
YMR066W
2697 nt
0.12
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
0.11
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
tF(GAA)Q
tF(GAA)Q
75 nt
0.1
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
YPR010C-A
YPR010C-A
219 nt
0.1
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
snR45
snR45
172 nt
0.1
□□□□□ -2.39
GLE1
Q12315
GLG1
YKR058W
1851 nt
0.07
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
snR65
snR65
100 nt
0.07
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
YLR232W
YLR232W
348 nt
0.07
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
YBR182C-A
YBR182C-A
195 nt
0.05
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
YDR524W-C
YDR524W-C
90 nt
0.04
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
APQ12
YIL040W
417 nt
0.04
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
0.04
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
YER181C
YER181C
324 nt
0.03
□□□□□ -2.4
GLE1
Q12315
SDH6
YDR379C-A
240 nt
0.02
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
YDR544C
YDR544C
429 nt
0.01
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
YBR099C
YBR099C
384 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
CSE1
YGL238W
2883 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
YGL041C
YGL041C
204 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
YPL152W-A
YPL152W-A
99 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
YBR131C-A
YBR131C-A
90 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
GLE1
Q12315
YBL039C-A
YBL039C-A
84 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
snR49
snR49
165 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
snR55
snR55
98 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
COG6
YNL041C
2520 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
YML099W-A
YML099W-A
330 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
YNL097C-B
YNL097C-B
123 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
YEL014C
YEL014C
306 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
YOR231C-A
YOR231C-A
201 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
EST1
YLR233C
2100 nt
-0.1
□□□□□ -2.42
GLE1
Q12315
TFB5
YDR079C-A
219 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
YGL182C
YGL182C
324 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
YOR314W-A
YOR314W-A
111 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
snR128
snR128
126 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
YJL182C
YJL182C
318 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
snR8
snR8
190 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
YOR302W
YOR302W
78 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
GLE1
Q12315
YDR210W
YDR210W
228 nt
-0.2
□□□□□ -2.44
GLE1
Q12315
YOR381W-A
YOR381W-A
168 nt
-0.2
□□□□□ -2.44
GLE1
Q12315
YGL188C-A
YGL188C-A
141 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
GLE1
Q12315
YGR164W
YGR164W
336 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
GLE1
Q12315
snR46
snR46
197 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
GLE1
Q12315
YOR170W
YOR170W
306 nt
-0.22
□□□□□ -2.44
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