Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.24□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 TMA7YLR262C-A 195 nt2.24□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 PET111YMR257C 2403 nt2.24□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 ADR1YDR216W 3972 nt2.24□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 CDC60YPL160W 3273 nt2.23□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 KOG1YHR186C 4674 nt2.23□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 ALY2YJL084C 3141 nt2.23□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 GCN2YDR283C 4980 nt2.23□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 TDA9YML081W 3756 nt2.22□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 PKH3YDR466W 2697 nt2.22□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 NIP1YMR309C 2439 nt2.22□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 SEY1YOR165W 2331 nt2.22□□□□□ -2.05
PUS1Q12211 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.21□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 YLR419WYLR419W 4308 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 RPL41AYDL184C 78 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 TOR2YKL203C 7425 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 SPO24YPR036W-A 204 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 KCS1YDR017C 3153 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS1Q12211 SEC31YDL195W 3822 nt2.14□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 BEM3YPL115C 3387 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 SYH1YPL105C 2550 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 FKS1YLR342W 5631 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 EMC5YIL027C 426 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 CHS1YNL192W 3396 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 TRM3YDL112W 4311 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 ANS1YHR126C 480 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 HER1YOR227W 3741 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 CHC1YGL206C 4962 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 KIP1YBL063W 3336 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS1Q12211 SIP4YJL089W 2490 nt2.09□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 EST1YLR233C 2100 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 snR190snR190 190 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 FAB1YFR019W 6837 nt2.07□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 PEP1YBL017C 4740 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 SPC110YDR356W 2835 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 UBR2YLR024C 5619 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 HIR3YJR140C 4947 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.04□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 BPH1YCR032W 6504 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 EST2YLR318W 2655 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 MYO2YOR326W 4725 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 PAN2YGL094C 3348 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS1Q12211 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 YAR009CYAR009C 3591 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 NUT1YGL151W 3399 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 MSH6YDR097C 3729 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 CTR9YOL145C 3234 nt2□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 RDS3YPR094W 324 nt2□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 snR69snR69 101 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 BUL2YML111W 2763 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.98□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 UTP21YLR409C 2820 nt1.98□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 ULP2YIL031W 3105 nt1.97□□□□□ -2.09
PUS1Q12211 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.95□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 MYO1YHR023W 5787 nt1.95□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 STO1YMR125W 2586 nt1.95□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 MYO4YAL029C 4416 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 NST1YNL091W 3723 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 MSH3YCR092C 3057 nt1.93□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 snR14snR14 160 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 PET309YLR067C 2898 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 CSE1YGL238W 2883 nt1.91□□□□□ -2.1
PUS1Q12211 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 YMR045CYMR045C 5268 nt1.89□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 IRE1YHR079C 3348 nt1.89□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.88□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 YOR093CYOR093C 4947 nt1.87□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 YCS4YLR272C 3531 nt1.87□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 SKI3YPR189W 4299 nt1.87□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 IRC20YLR247C 4671 nt1.87□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 RAD50YNL250W 3939 nt1.86□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 NUP192YJL039C 5052 nt1.86□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 ROM2YLR371W 4071 nt1.85□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 CFT1YDR301W 4074 nt1.84□□□□□ -2.11
PUS1Q12211 GEA2YEL022W 4380 nt1.83□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 snR40snR40 97 nt1.83□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 KAP122YGL016W 3246 nt1.83□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 DNF3YMR162C 4971 nt1.82□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 SEC8YPR055W 3198 nt1.82□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 MON2YNL297C 4911 nt1.81□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 VPS15YBR097W 4365 nt1.81□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 SXM1YDR395W 2835 nt1.8□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 PAU12YGR294W 363 nt1.79□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.78□□□□□ -2.12
PUS1Q12211 TRM732YMR259C 4263 nt1.77□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 FIG2YCR089W 4830 nt1.77□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.77□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 MEC1YBR136W 7107 nt1.76□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 PRP16YKR086W 3216 nt1.76□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 SMC4YLR086W 4257 nt1.75□□□□□ -2.13
PUS1Q12211 SEC3YER008C 4011 nt1.75□□□□□ -2.13
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