Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 NUT1YGL151W 3399 nt2.63□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 NST1YNL091W 3723 nt2.63□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 SYH1YPL105C 2550 nt2.62□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 MSB1YOR188W 3414 nt2.62□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 RTT101YJL047C 2529 nt2.61□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 SSN2YDR443C 4263 nt2.61□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 STO1YMR125W 2586 nt2.6□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 CSE1YGL238W 2883 nt2.6□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 TUS1YLR425W 3924 nt2.6□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 HSL1YKL101W 4557 nt2.59□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.59□□□□□ -2
NCR1Q12200 IRE1YHR079C 3348 nt2.57□□□□□ -2
NCR1Q12200 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.57□□□□□ -2
NCR1Q12200 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.56□□□□□ -2
NCR1Q12200 GEA1YJR031C 4227 nt2.56□□□□□ -2
NCR1Q12200 AMS1YGL156W 3252 nt2.56□□□□□ -2
NCR1Q12200 PDR11YIL013C 4236 nt2.55□□□□□ -2
NCR1Q12200 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt2.55□□□□□ -2
NCR1Q12200 ESL2YKR096W 3588 nt2.55□□□□□ -2
NCR1Q12200 SXM1YDR395W 2835 nt2.55□□□□□ -2
NCR1Q12200 TRA1YHR099W 11235 nt2.54□□□□□ -2
NCR1Q12200 DGR1YNL130C-A 147 nt2.52□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 ULP2YIL031W 3105 nt2.51□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 CHC1YGL206C 4962 nt2.5□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 UBR1YGR184C 5853 nt2.5□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 HIR3YJR140C 4947 nt2.5□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 TOR1YJR066W 7413 nt2.49□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 NUP170YBL079W 4509 nt2.49□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 MSH6YDR097C 3729 nt2.48□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.48□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 IRA2YOL081W 9240 nt2.47□□□□□ -2.01
NCR1Q12200 SEC8YPR055W 3198 nt2.46□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 KOG1YHR186C 4674 nt2.46□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.45□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 SSD1YDR293C 3753 nt2.45□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 KIP1YBL063W 3336 nt2.44□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 PAU12YGR294W 363 nt2.44□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 RAD50YNL250W 3939 nt2.44□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 PET309YLR067C 2898 nt2.43□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 PSD2YGR170W 3417 nt2.43□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 PRP16YKR086W 3216 nt2.43□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 YSP1YHR155W 3687 nt2.42□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 IRC20YLR247C 4671 nt2.42□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 TOP2YNL088W 4287 nt2.42□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 STH1YIL126W 4080 nt2.42□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 UTP21YLR409C 2820 nt2.41□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.41□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 TDA9YML081W 3756 nt2.41□□□□□ -2.02
NCR1Q12200 MSH3YCR092C 3057 nt2.4□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 CSF1YLR087C 8877 nt2.39□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 DNF1YER166W 4716 nt2.39□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 SEC3YER008C 4011 nt2.38□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 HUG1YML058W-A 207 nt2.38□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 REV3YPL167C 4515 nt2.38□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 SEC16YPL085W 6588 nt2.37□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 YLR422WYLR422W 5799 nt2.36□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 YLR419WYLR419W 4308 nt2.36□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 SPF1YEL031W 3648 nt2.35□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 CAT8YMR280C 4302 nt2.35□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 BNI1YNL271C 5862 nt2.35□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 UTP22YGR090W 3714 nt2.34□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 GEA2YEL022W 4380 nt2.34□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 YCS4YLR272C 3531 nt2.34□□□□□ -2.03
NCR1Q12200 FAR11YNL127W 2862 nt2.33□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 KRE33YNL132W 3171 nt2.33□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 MSN5YDR335W 3675 nt2.32□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 VPS13YLL040C 9435 nt2.32□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 GIP3YPL137C 3831 nt2.32□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.32□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 KAP122YGL016W 3246 nt2.31□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.3□□□□□ -2.04
NCR1Q12200 RAV1YJR033C 4074 nt2.26□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 UBP2YOR124C 3819 nt2.26□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 CDC25YLR310C 4770 nt2.26□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 YMR160WYMR160W 2451 nt2.24□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 FYV8YGR196C 2454 nt2.24□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.23□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.22□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 SMC4YLR086W 4257 nt2.22□□□□□ -2.05
NCR1Q12200 TOR2YKL203C 7425 nt2.21□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 YOL098CYOL098C 3114 nt2.2□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 ATG9YDL149W 2994 nt2.2□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.18□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 BPH1YCR032W 6504 nt2.17□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 SPP41YDR464W 4308 nt2.17□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.17□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 UBR2YLR024C 5619 nt2.16□□□□□ -2.06
NCR1Q12200 INO80YGL150C 4470 nt2.14□□□□□ -2.07
NCR1Q12200 snR67snR67 82 nt2.13□□□□□ -2.07
NCR1Q12200 APL3YBL037W 3078 nt2.13□□□□□ -2.07
NCR1Q12200 MYO4YAL029C 4416 nt2.11□□□□□ -2.07
NCR1Q12200 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.11□□□□□ -2.07
NCR1Q12200 NUP192YJL039C 5052 nt2.09□□□□□ -2.07
NCR1Q12200 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.08□□□□□ -2.08
NCR1Q12200 FAB1YFR019W 6837 nt2.07□□□□□ -2.08
NCR1Q12200 HER1YOR227W 3741 nt2.06□□□□□ -2.08
NCR1Q12200 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.06□□□□□ -2.08
NCR1Q12200 SKI3YPR189W 4299 nt2.05□□□□□ -2.08
NCR1Q12200 USO1YDL058W 5373 nt2.04□□□□□ -2.08
NCR1Q12200 FKS1YLR342W 5631 nt2.04□□□□□ -2.08
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