Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 AXL1YPR122W 3627 nt2.64□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 MET18YIL128W 3099 nt2.63□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 AMS1YGL156W 3252 nt2.63□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 snR70snR70 164 nt2.63□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 CHC1YGL206C 4962 nt2.62□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 DGR1YNL130C-A 147 nt2.62□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 TOP2YNL088W 4287 nt2.62□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 PET309YLR067C 2898 nt2.61□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 BUL2YML111W 2763 nt2.61□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 SIR4YDR227W 4077 nt2.6□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 PRP16YKR086W 3216 nt2.6□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 HSL1YKL101W 4557 nt2.59□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.59□□□□□ -1.99
IOC2Q12072 SPC110YDR356W 2835 nt2.59□□□□□ -2
IOC2Q12072 SPF1YEL031W 3648 nt2.58□□□□□ -2
IOC2Q12072 CSF1YLR087C 8877 nt2.58□□□□□ -2
IOC2Q12072 STO1YMR125W 2586 nt2.57□□□□□ -2
IOC2Q12072 NUT1YGL151W 3399 nt2.56□□□□□ -2
IOC2Q12072 MSB1YOR188W 3414 nt2.56□□□□□ -2
IOC2Q12072 RAD50YNL250W 3939 nt2.54□□□□□ -2
IOC2Q12072 IRA2YOL081W 9240 nt2.54□□□□□ -2
IOC2Q12072 NST1YNL091W 3723 nt2.54□□□□□ -2
IOC2Q12072 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 HUG1YML058W-A 207 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 MSH6YDR097C 3729 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 UBR1YGR184C 5853 nt2.53□□□□□ -2
IOC2Q12072 ULP2YIL031W 3105 nt2.52□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 FAR11YNL127W 2862 nt2.52□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 DNA2YHR164C 4569 nt2.52□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 VPS13YLL040C 9435 nt2.51□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 PAU12YGR294W 363 nt2.51□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 FKS3YMR306W 5358 nt2.5□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 GEA2YEL022W 4380 nt2.49□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 UTP21YLR409C 2820 nt2.49□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.49□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.49□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 KRE33YNL132W 3171 nt2.49□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 HIR3YJR140C 4947 nt2.49□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 SEC16YPL085W 6588 nt2.47□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 YSP1YHR155W 3687 nt2.47□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.47□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 KIP1YBL063W 3336 nt2.47□□□□□ -2.01
IOC2Q12072 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.46□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 TUS1YLR425W 3924 nt2.46□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 CAT8YMR280C 4302 nt2.46□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 STH1YIL126W 4080 nt2.45□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 DNF1YER166W 4716 nt2.44□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 GIP3YPL137C 3831 nt2.44□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 YOL098CYOL098C 3114 nt2.44□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 BNI1YNL271C 5862 nt2.43□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 SEC8YPR055W 3198 nt2.43□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 KOG1YHR186C 4674 nt2.41□□□□□ -2.02
IOC2Q12072 FYV8YGR196C 2454 nt2.4□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 MSH3YCR092C 3057 nt2.4□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 PDR11YIL013C 4236 nt2.39□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 UTP22YGR090W 3714 nt2.39□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 BPH1YCR032W 6504 nt2.37□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.37□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 SSD1YDR293C 3753 nt2.37□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 TDA9YML081W 3756 nt2.36□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.36□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 UBP2YOR124C 3819 nt2.35□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 RAV1YJR033C 4074 nt2.34□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.34□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 IRC20YLR247C 4671 nt2.34□□□□□ -2.03
IOC2Q12072 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.32□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 YMR160WYMR160W 2451 nt2.32□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 SMC4YLR086W 4257 nt2.31□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 SPP41YDR464W 4308 nt2.3□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.29□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 APL3YBL037W 3078 nt2.29□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 SEC3YER008C 4011 nt2.29□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 USO1YDL058W 5373 nt2.28□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 NUP170YBL079W 4509 nt2.28□□□□□ -2.04
IOC2Q12072 YLR422WYLR422W 5799 nt2.27□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 KAP122YGL016W 3246 nt2.27□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 FKS1YLR342W 5631 nt2.25□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 YLR419WYLR419W 4308 nt2.24□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 MSN5YDR335W 3675 nt2.23□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 YMR045CYMR045C 5268 nt2.23□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 snR67snR67 82 nt2.22□□□□□ -2.05
IOC2Q12072 TOR2YKL203C 7425 nt2.2□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 MYO4YAL029C 4416 nt2.2□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 CDC25YLR310C 4770 nt2.19□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 HER1YOR227W 3741 nt2.18□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.16□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.16□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 UBR2YLR024C 5619 nt2.16□□□□□ -2.06
IOC2Q12072 NEO1YIL048W 3456 nt2.11□□□□□ -2.07
IOC2Q12072 INO80YGL150C 4470 nt2.1□□□□□ -2.07
IOC2Q12072 ATG9YDL149W 2994 nt2.07□□□□□ -2.08
IOC2Q12072 YCS4YLR272C 3531 nt2.03□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 MLP2YIL149C 5040 nt2.02□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 SKI3YPR189W 4299 nt2.02□□□□□ -2.09
IOC2Q12072 CLU1YMR012W 3834 nt2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms