Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YCR022CYCR022C 345 nt0.59□□□□□ -2.31
VPS54Q12071 PAU12YGR294W 363 nt0.59□□□□□ -2.31
VPS54Q12071 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.59□□□□□ -2.31
VPS54Q12071 snR65snR65 100 nt0.58□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.58□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.58□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YGL052WYGL052W 306 nt0.57□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.57□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.57□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 COY1YKL179C 2040 nt0.56□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YER181CYER181C 324 nt0.56□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.56□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YLR041WYLR041W 321 nt0.56□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YPR092WYPR092W 306 nt0.56□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 MLP1YKR095W 5628 nt0.55□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 ULI1YFR026C 510 nt0.55□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.55□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YOR345CYOR345C 351 nt0.55□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 FMP27YLR454W 7887 nt0.55□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.54□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 BLI1YKL061W 342 nt0.54□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.54□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.54□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 snR80snR80 171 nt0.53□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.53□□□□□ -2.32
VPS54Q12071 ULP2YIL031W 3105 nt0.53□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 PET111YMR257C 2403 nt0.52□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.52□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.51□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 YOL014WYOL014W 375 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 MLP2YIL149C 5040 nt0.5□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 snR49snR49 165 nt0.49□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 YOR302WYOR302W 78 nt0.48□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.48□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.47□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.47□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 COX12YLR038C 252 nt0.47□□□□□ -2.33
VPS54Q12071 snR55snR55 98 nt0.46□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 ABF2YMR072W 552 nt0.46□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YDR366CYDR366C 399 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 SBH1YER087C-B 249 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.45□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 NNF2YGR089W 2811 nt0.44□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.44□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 snR8snR8 190 nt0.43□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.43□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YEL014CYEL014C 306 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 APQ12YIL040W 417 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YKU70YMR284W 1809 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 TRS65YGR166W 1683 nt0.42□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.41□□□□□ -2.34
VPS54Q12071 RPM2YML091C 3609 nt0.4□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 BUL2YML111W 2763 nt0.4□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 NIP1YMR309C 2439 nt0.39□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 SNU13YEL026W 381 nt0.39□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 RPS26AYGL189C 360 nt0.39□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 YDR544CYDR544C 429 nt0.38□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 AI1Q0050 2505 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.37□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.36□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 YJL182CYJL182C 318 nt0.35□□□□□ -2.35
VPS54Q12071 snR52snR52 92 nt0.34□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 ESP1YGR098C 4893 nt0.33□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 ORC3YLL004W 1851 nt0.33□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.33□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 TAH1YCR060W 336 nt0.32□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 JLP2YMR132C 627 nt0.32□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 UTP8YGR128C 2142 nt0.31□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 RCO1YMR075W 2055 nt0.31□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 PRP39YML046W 1890 nt0.31□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 SPG3YDR504C 384 nt0.29□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.28□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.36
VPS54Q12071 THO2YNL139C 4794 nt0.28□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 BIR1YJR089W 2865 nt0.27□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YLR232WYLR232W 348 nt0.27□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.27□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 SDH6YDR379C-A 240 nt0.26□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YGL182CYGL182C 324 nt0.26□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YJL150WYJL150W 303 nt0.26□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.26□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.25□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 GLG1YKR058W 1851 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YBL053WYBL053W 375 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YNL198CYNL198C 303 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.24□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 snR46snR46 197 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 CSE1YGL238W 2883 nt0.23□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YEL073CYEL073C 324 nt0.22□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 COG6YNL041C 2520 nt0.22□□□□□ -2.37
VPS54Q12071 YDR210WYDR210W 228 nt0.2□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.2□□□□□ -2.38
VPS54Q12071 snR39BsnR39B 96 nt0.2□□□□□ -2.38
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