Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.46□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 CHC1YGL206C 4962 nt2.46□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 UBP3YER151C 2739 nt2.45□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 SPF1YEL031W 3648 nt2.45□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 TOR1YJR066W 7413 nt2.45□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 RGA1YOR127W 3024 nt2.44□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 SEC21YNL287W 2808 nt2.43□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 MGA2YIR033W 3342 nt2.42□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 HUG1YML058W-A 207 nt2.42□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 KOG1YHR186C 4674 nt2.41□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 NUP192YJL039C 5052 nt2.41□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 KCS1YDR017C 3153 nt2.41□□□□□ -2.02
TYW1Q08960 ATG9YDL149W 2994 nt2.4□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.4□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 CHS1YNL192W 3396 nt2.4□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.4□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 RPL26BYGR034W 384 nt2.39□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 WAR1YML076C 2835 nt2.38□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 SEC10YLR166C 2616 nt2.38□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 AZF1YOR113W 2745 nt2.38□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 YOL098CYOL098C 3114 nt2.37□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 YKL225WYKL225W 348 nt2.37□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 SKI3YPR189W 4299 nt2.37□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 CLU1YMR012W 3834 nt2.37□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 UFD4YKL010C 4452 nt2.36□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 IRA2YOL081W 9240 nt2.36□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 snR190snR190 190 nt2.34□□□□□ -2.03
TYW1Q08960 UBP2YOR124C 3819 nt2.33□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 TFC3YAL001C 3483 nt2.32□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 BNI1YNL271C 5862 nt2.3□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.29□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 KAP122YGL016W 3246 nt2.29□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 PIK1YNL267W 3201 nt2.29□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 NNF2YGR089W 2811 nt2.28□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.28□□□□□ -2.04
TYW1Q08960 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.27□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 SEC3YER008C 4011 nt2.26□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 STO1YMR125W 2586 nt2.25□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 BRE1YDL074C 2103 nt2.24□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 BRR2YER172C 6492 nt2.23□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.23□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 snR14snR14 160 nt2.23□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 SMC4YLR086W 4257 nt2.22□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 SEC8YPR055W 3198 nt2.22□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 PKH3YDR466W 2697 nt2.22□□□□□ -2.05
TYW1Q08960 FKS1YLR342W 5631 nt2.21□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 APL3YBL037W 3078 nt2.2□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 SWI4YER111C 3282 nt2.2□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 NUP145YGL092W 3954 nt2.19□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 YLR419WYLR419W 4308 nt2.18□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.18□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 MSN5YDR335W 3675 nt2.18□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 BEM3YPL115C 3387 nt2.17□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 USO1YDL058W 5373 nt2.16□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 TMA7YLR262C-A 195 nt2.16□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.16□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 MSH3YCR092C 3057 nt2.16□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 SSK2YNR031C 4740 nt2.16□□□□□ -2.06
TYW1Q08960 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.15□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 AI1Q0050 2505 nt2.14□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 YSP1YHR155W 3687 nt2.14□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 UBR2YLR024C 5619 nt2.13□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 snR38snR38 95 nt2.13□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 NEO1YIL048W 3456 nt2.11□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.1□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 DNF1YER166W 4716 nt2.1□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 PRP16YKR086W 3216 nt2.1□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 PET127YOR017W 2403 nt2.09□□□□□ -2.07
TYW1Q08960 ULP2YIL031W 3105 nt2.09□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 GEA2YEL022W 4380 nt2.09□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 SKI7YOR076C 2244 nt2.07□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 RPL41AYDL184C 78 nt2.07□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 EST1YLR233C 2100 nt2.07□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 DGR1YNL130C-A 147 nt2.07□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 DNF3YMR162C 4971 nt2.06□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.06□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 FIG2YCR089W 4830 nt2.05□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 NST1YNL091W 3723 nt2.05□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.05□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 CFT1YDR301W 4074 nt2.04□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.04□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 NIP1YMR309C 2439 nt2.04□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.04□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 BST1YFL025C 3090 nt2.04□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 TOR2YKL203C 7425 nt2.03□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 YMR045CYMR045C 5268 nt2.03□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 TRM732YMR259C 4263 nt2.03□□□□□ -2.08
TYW1Q08960 CAT8YMR280C 4302 nt2.02□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.02□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 MEC1YBR136W 7107 nt2.02□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 NUP188YML103C 4968 nt2.01□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 PAU12YGR294W 363 nt2.01□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.01□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 PAU24YBR301W 363 nt2.01□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 PMD1YER132C 5262 nt2□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.99□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 snR69snR69 101 nt1.99□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.99□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 LAA1YJL207C 6045 nt1.99□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 YGR130CYGR130C 2451 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.4 ms