Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC63Q05C16 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms