Protein–RNA interactions for Protein: P39008

POP2, Poly(A) ribonuclease POP2, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP2P39008 YLR282CYLR282C 342 nt0.44□□□□□ -2.34
POP2P39008 YOR345CYOR345C 351 nt0.44□□□□□ -2.34
POP2P39008 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.44□□□□□ -2.34
POP2P39008 ULI1YFR026C 510 nt0.43□□□□□ -2.34
POP2P39008 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.43□□□□□ -2.34
POP2P39008 ULP2YIL031W 3105 nt0.42□□□□□ -2.34
POP2P39008 ESP1YGR098C 4893 nt0.42□□□□□ -2.34
POP2P39008 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.42□□□□□ -2.34
POP2P39008 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.42□□□□□ -2.34
POP2P39008 ABF2YMR072W 552 nt0.42□□□□□ -2.34
POP2P39008 YCR022CYCR022C 345 nt0.41□□□□□ -2.34
POP2P39008 OST4YDL232W 111 nt0.41□□□□□ -2.34
POP2P39008 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.41□□□□□ -2.34
POP2P39008 YER181CYER181C 324 nt0.41□□□□□ -2.34
POP2P39008 COX5BYIL111W 456 nt0.41□□□□□ -2.34
POP2P39008 FMP27YLR454W 7887 nt0.4□□□□□ -2.34
POP2P39008 COX12YLR038C 252 nt0.4□□□□□ -2.35
POP2P39008 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.4□□□□□ -2.35
POP2P39008 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.4□□□□□ -2.35
POP2P39008 snR49snR49 165 nt0.4□□□□□ -2.35
POP2P39008 PET111YMR257C 2403 nt0.39□□□□□ -2.35
POP2P39008 BIR1YJR089W 2865 nt0.39□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.39□□□□□ -2.35
POP2P39008 PAU12YGR294W 363 nt0.39□□□□□ -2.35
POP2P39008 snR55snR55 98 nt0.38□□□□□ -2.35
POP2P39008 snR80snR80 171 nt0.38□□□□□ -2.35
POP2P39008 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.38□□□□□ -2.35
POP2P39008 BLI1YKL061W 342 nt0.38□□□□□ -2.35
POP2P39008 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.38□□□□□ -2.35
POP2P39008 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.37□□□□□ -2.35
POP2P39008 PRP42YDR235W 1635 nt0.37□□□□□ -2.35
POP2P39008 SBH1YER087C-B 249 nt0.36□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 APQ12YIL040W 417 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 YOR302WYOR302W 78 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 YKU70YMR284W 1809 nt0.35□□□□□ -2.35
POP2P39008 YDR366CYDR366C 399 nt0.33□□□□□ -2.36
POP2P39008 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.33□□□□□ -2.36
POP2P39008 ORC3YLL004W 1851 nt0.33□□□□□ -2.36
POP2P39008 YEL014CYEL014C 306 nt0.32□□□□□ -2.36
POP2P39008 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.32□□□□□ -2.36
POP2P39008 AI1Q0050 2505 nt0.32□□□□□ -2.36
POP2P39008 YDR544CYDR544C 429 nt0.31□□□□□ -2.36
POP2P39008 YLR041WYLR041W 321 nt0.31□□□□□ -2.36
POP2P39008 NNF2YGR089W 2811 nt0.3□□□□□ -2.36
POP2P39008 SNU13YEL026W 381 nt0.3□□□□□ -2.36
POP2P39008 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.3□□□□□ -2.36
POP2P39008 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.29□□□□□ -2.36
POP2P39008 BUL2YML111W 2763 nt0.28□□□□□ -2.36
POP2P39008 UTP8YGR128C 2142 nt0.28□□□□□ -2.36
POP2P39008 RPS26AYGL189C 360 nt0.28□□□□□ -2.36
POP2P39008 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.28□□□□□ -2.36
POP2P39008 TRS65YGR166W 1683 nt0.27□□□□□ -2.37
POP2P39008 TAH1YCR060W 336 nt0.27□□□□□ -2.37
POP2P39008 snR8snR8 190 nt0.27□□□□□ -2.37
POP2P39008 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.27□□□□□ -2.37
POP2P39008 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.27□□□□□ -2.37
POP2P39008 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.27□□□□□ -2.37
POP2P39008 YJL182CYJL182C 318 nt0.26□□□□□ -2.37
POP2P39008 RCO1YMR075W 2055 nt0.25□□□□□ -2.37
POP2P39008 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.25□□□□□ -2.37
POP2P39008 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.25□□□□□ -2.37
POP2P39008 PRP39YML046W 1890 nt0.24□□□□□ -2.37
POP2P39008 YLR232WYLR232W 348 nt0.24□□□□□ -2.37
POP2P39008 THO2YNL139C 4794 nt0.24□□□□□ -2.37
POP2P39008 NIP1YMR309C 2439 nt0.24□□□□□ -2.37
POP2P39008 SDH6YDR379C-A 240 nt0.23□□□□□ -2.37
POP2P39008 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.22□□□□□ -2.37
POP2P39008 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.21□□□□□ -2.38
POP2P39008 snR52snR52 92 nt0.2□□□□□ -2.38
POP2P39008 CSE1YGL238W 2883 nt0.2□□□□□ -2.38
POP2P39008 YEL073CYEL073C 324 nt0.19□□□□□ -2.38
POP2P39008 YGL182CYGL182C 324 nt0.19□□□□□ -2.38
POP2P39008 QCR9YGR183C 201 nt0.19□□□□□ -2.38
POP2P39008 YOL014WYOL014W 375 nt0.19□□□□□ -2.38
POP2P39008 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.19□□□□□ -2.38
POP2P39008 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.18□□□□□ -2.38
POP2P39008 COG6YNL041C 2520 nt0.17□□□□□ -2.38
POP2P39008 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.15□□□□□ -2.39
POP2P39008 snR46snR46 197 nt0.13□□□□□ -2.39
POP2P39008 GLG1YKR058W 1851 nt0.13□□□□□ -2.39
POP2P39008 YDR210WYDR210W 228 nt0.12□□□□□ -2.39
POP2P39008 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.11□□□□□ -2.39
POP2P39008 JLP2YMR132C 627 nt0.11□□□□□ -2.39
POP2P39008 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.11□□□□□ -2.39
POP2P39008 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.1□□□□□ -2.39
POP2P39008 SPG3YDR504C 384 nt0.09□□□□□ -2.4
POP2P39008 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.09□□□□□ -2.4
POP2P39008 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.09□□□□□ -2.4
POP2P39008 snR39BsnR39B 96 nt0.09□□□□□ -2.4
POP2P39008 SOV1YMR066W 2697 nt0.08□□□□□ -2.4
POP2P39008 YJL150WYJL150W 303 nt0.08□□□□□ -2.4
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