Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.77□□□□□ -1.97
SSP1P38871 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.77□□□□□ -1.97
SSP1P38871 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.77□□□□□ -1.97
SSP1P38871 UBR2YLR024C 5619 nt2.77□□□□□ -1.97
SSP1P38871 BCK1YJL095W 4437 nt2.76□□□□□ -1.97
SSP1P38871 FKS3YMR306W 5358 nt2.76□□□□□ -1.97
SSP1P38871 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.75□□□□□ -1.97
SSP1P38871 ANS1YHR126C 480 nt2.73□□□□□ -1.97
SSP1P38871 TFC3YAL001C 3483 nt2.72□□□□□ -1.97
SSP1P38871 TRA1YHR099W 11235 nt2.71□□□□□ -1.97
SSP1P38871 YKL225WYKL225W 348 nt2.71□□□□□ -1.98
SSP1P38871 PRP16YKR086W 3216 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 UBP2YOR124C 3819 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 BNR1YIL159W 4128 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 ULP2YIL031W 3105 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 SGS1YMR190C 4344 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 YSP1YHR155W 3687 nt2.7□□□□□ -1.98
SSP1P38871 UTP22YGR090W 3714 nt2.69□□□□□ -1.98
SSP1P38871 APL3YBL037W 3078 nt2.69□□□□□ -1.98
SSP1P38871 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.68□□□□□ -1.98
SSP1P38871 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.67□□□□□ -1.98
SSP1P38871 YLR419WYLR419W 4308 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP1P38871 GEA2YEL022W 4380 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP1P38871 MGA2YIR033W 3342 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP1P38871 SWI4YER111C 3282 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP1P38871 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP1P38871 ARP8YOR141C 2646 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP1P38871 PKH3YDR466W 2697 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP1P38871 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP1P38871 YOR055WYOR055W 435 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP1P38871 PDR1YGL013C 3207 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP1P38871 MSN5YDR335W 3675 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP1P38871 NUP145YGL092W 3954 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP1P38871 PDR11YIL013C 4236 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP1P38871 IRA2YOL081W 9240 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP1P38871 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP1P38871 IRC20YLR247C 4671 nt2.58□□□□□ -2
SSP1P38871 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.58□□□□□ -2
SSP1P38871 EST1YLR233C 2100 nt2.58□□□□□ -2
SSP1P38871 snR69snR69 101 nt2.55□□□□□ -2
SSP1P38871 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.54□□□□□ -2
SSP1P38871 CLU1YMR012W 3834 nt2.54□□□□□ -2
SSP1P38871 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.53□□□□□ -2
SSP1P38871 SXM1YDR395W 2835 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP1P38871 NST1YNL091W 3723 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP1P38871 NUP170YBL079W 4509 nt2.52□□□□□ -2.01
SSP1P38871 PET127YOR017W 2403 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP1P38871 DNF1YER166W 4716 nt2.51□□□□□ -2.01
SSP1P38871 BRE1YDL074C 2103 nt2.5□□□□□ -2.01
SSP1P38871 RPL41AYDL184C 78 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP1P38871 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP1P38871 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP1P38871 RDS3YPR094W 324 nt2.49□□□□□ -2.01
SSP1P38871 BNI1YNL271C 5862 nt2.48□□□□□ -2.01
SSP1P38871 CSE1YGL238W 2883 nt2.47□□□□□ -2.01
SSP1P38871 USO1YDL058W 5373 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP1P38871 TMA7YLR262C-A 195 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP1P38871 MSH3YCR092C 3057 nt2.46□□□□□ -2.02
SSP1P38871 MSB1YOR188W 3414 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP1P38871 snR75snR75 89 nt2.45□□□□□ -2.02
SSP1P38871 SCD5YOR329C 2619 nt2.44□□□□□ -2.02
SSP1P38871 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.43□□□□□ -2.02
SSP1P38871 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.43□□□□□ -2.02
SSP1P38871 TRM732YMR259C 4263 nt2.42□□□□□ -2.02
SSP1P38871 BPH1YCR032W 6504 nt2.41□□□□□ -2.02
SSP1P38871 VPS13YLL040C 9435 nt2.4□□□□□ -2.03
SSP1P38871 MON2YNL297C 4911 nt2.4□□□□□ -2.03
SSP1P38871 TOR2YKL203C 7425 nt2.4□□□□□ -2.03
SSP1P38871 HUG1YML058W-A 207 nt2.39□□□□□ -2.03
SSP1P38871 BST1YFL025C 3090 nt2.39□□□□□ -2.03
SSP1P38871 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.38□□□□□ -2.03
SSP1P38871 SKI7YOR076C 2244 nt2.36□□□□□ -2.03
SSP1P38871 NUP188YML103C 4968 nt2.35□□□□□ -2.03
SSP1P38871 snR38snR38 95 nt2.34□□□□□ -2.03
SSP1P38871 SEC16YPL085W 6588 nt2.33□□□□□ -2.04
SSP1P38871 AI1Q0050 2505 nt2.32□□□□□ -2.04
SSP1P38871 CSF1YLR087C 8877 nt2.32□□□□□ -2.04
SSP1P38871 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.32□□□□□ -2.04
SSP1P38871 YOL098CYOL098C 3114 nt2.3□□□□□ -2.04
SSP1P38871 SIP4YJL089W 2490 nt2.29□□□□□ -2.04
SSP1P38871 REV3YPL167C 4515 nt2.29□□□□□ -2.04
SSP1P38871 PMD1YER132C 5262 nt2.29□□□□□ -2.04
SSP1P38871 YMR045CYMR045C 5268 nt2.29□□□□□ -2.04
SSP1P38871 NIP1YMR309C 2439 nt2.29□□□□□ -2.04
SSP1P38871 EST2YLR318W 2655 nt2.28□□□□□ -2.04
SSP1P38871 CAT8YMR280C 4302 nt2.28□□□□□ -2.05
SSP1P38871 BUL2YML111W 2763 nt2.27□□□□□ -2.05
SSP1P38871 CDC39YCR093W 6327 nt2.25□□□□□ -2.05
SSP1P38871 PAU12YGR294W 363 nt2.24□□□□□ -2.05
SSP1P38871 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.24□□□□□ -2.05
SSP1P38871 DGR1YNL130C-A 147 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP1P38871 SPP41YDR464W 4308 nt2.23□□□□□ -2.05
SSP1P38871 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.22□□□□□ -2.05
SSP1P38871 CFT1YDR301W 4074 nt2.2□□□□□ -2.06
SSP1P38871 NEO1YIL048W 3456 nt2.19□□□□□ -2.06
SSP1P38871 FYV8YGR196C 2454 nt2.17□□□□□ -2.06
SSP1P38871 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.14□□□□□ -2.07
SSP1P38871 LAA1YJL207C 6045 nt2.13□□□□□ -2.07
SSP1P38871 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.12□□□□□ -2.07
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