Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGM1P36871 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGM1P36871 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGM1P36871 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGM1P36871 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGM1P36871 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGM1P36871 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGM1P36871 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms