Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD21O60216 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD21O60216 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD21O60216 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD21O60216 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD21O60216 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD21O60216 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD21O60216 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD21O60216 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD21O60216 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD21O60216 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD21O60216 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms