Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB3Q9UKI3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms