Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC82Q8N4S0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms