Protein–RNA interactions for Protein: Q12102

CFT2, Cleavage factor two protein 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CFT2Q12102 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 RPL33BYOR234C 324 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 PDE2YOR360C 1581 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 FIG4YNL325C 2640 nt1.28□□□□□ -2.2
CFT2Q12102 snR80snR80 171 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 IES4YOR189W 351 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YBR206WYBR206W 324 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 SLD3YGL113W 2007 nt1.27□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 SEC3YER008C 4011 nt1.26□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.26□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 CDC39YCR093W 6327 nt1.25□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YGL052WYGL052W 306 nt1.25□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 PAM16YJL104W 450 nt1.25□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.25□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YLL020CYLL020C 306 nt1.25□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 snR49snR49 165 nt1.25□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YPR117WYPR117W 7470 nt1.24□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 EAF1YDR359C 2949 nt1.24□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.24□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 PAN2YGL094C 3348 nt1.24□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 SPT7YBR081C 3999 nt1.24□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 STB6YKL072W 2301 nt1.23□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 SET3YKR029C 2256 nt1.23□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 STO1YMR125W 2586 nt1.23□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 MCM10YIL150C 1716 nt1.23□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 UBP3YER151C 2739 nt1.23□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.22□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 VAM6YDL077C 3150 nt1.22□□□□□ -2.21
CFT2Q12102 SCC2YDR180W 4482 nt1.21□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 snR74snR74 88 nt1.21□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 ABF2YMR072W 552 nt1.21□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 NPR2YEL062W 1848 nt1.2□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YPR092WYPR092W 306 nt1.2□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 UTP20YBL004W 7482 nt1.2□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 BUD3YCL014W 4911 nt1.19□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.19□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 ECM12YHR021W-A 456 nt1.19□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.19□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 NUP157YER105C 4176 nt1.19□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 SMC1YFL008W 3678 nt1.18□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 snR55snR55 98 nt1.18□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.18□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.18□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 WAR1YML076C 2835 nt1.17□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YJR029WYJR029W 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 DOP1YDR141C 5097 nt1.17□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 YOR302WYOR302W 78 nt1.16□□□□□ -2.22
CFT2Q12102 SGF11YPL047W 300 nt1.15□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 OLI1Q0130 231 nt1.14□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.14□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 PRP16YKR086W 3216 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.12□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 GEA2YEL022W 4380 nt1.11□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.11□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.11□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.11□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 JLP2YMR132C 627 nt1.1□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YOL014WYOL014W 375 nt1.1□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 BEM2YER155C 6504 nt1.1□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 SPG3YDR504C 384 nt1.09□□□□□ -2.23
CFT2Q12102 YNL211CYNL211C 261 nt1.08□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 CMC4YMR194C-B 222 nt1.07□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.07□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.07□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YKU70YMR284W 1809 nt1.07□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YDL073WYDL073W 2955 nt1.07□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 PAA1YDR071C 576 nt1.06□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 NOP9YJL010C 2001 nt1.06□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YDL196WYDL196W 330 nt1.05□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 APQ12YIL040W 417 nt1.05□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.05□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.04□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YOR345CYOR345C 351 nt1.04□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 ISD11YER048W-A 285 nt1.03□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YPL044CYPL044C 549 nt1.03□□□□□ -2.24
CFT2Q12102 YMR160WYMR160W 2451 nt1.02□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.02□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 BLI1YKL061W 342 nt1.01□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 RPL26BYGR034W 384 nt1□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.99□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.98□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 ULI1YFR026C 510 nt0.98□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.98□□□□□ -2.25
CFT2Q12102 ASE1YOR058C 2658 nt0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms