Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 POL5YEL055C 3069 nt1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 SLX4YLR135W 2247 nt1.99□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 CTF4YPR135W 2784 nt1.98□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 RTP1YMR185W 2946 nt1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 PAA1YDR071C 576 nt1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.97□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 CFT1YDR301W 4074 nt1.96□□□□□ -2.09
GDE1Q02979 TTI1YKL033W 3117 nt1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 MYO2YOR326W 4725 nt1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YJL022WYJL022W 309 nt1.96□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 CDC25YLR310C 4770 nt1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 CLU1YMR012W 3834 nt1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 KAP122YGL016W 3246 nt1.95□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 BPH1YCR032W 6504 nt1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 COX12YLR038C 252 nt1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 RPS30BYOR182C 192 nt1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 ROM2YLR371W 4071 nt1.94□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YOR093CYOR093C 4947 nt1.93□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YAR009CYAR009C 3591 nt1.93□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YNL170WYNL170W 396 nt1.92□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 SMC4YLR086W 4257 nt1.92□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YNL211CYNL211C 261 nt1.91□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YOR019WYOR019W 2193 nt1.91□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YLR419WYLR419W 4308 nt1.9□□□□□ -2.1
GDE1Q02979 YPL044CYPL044C 549 nt1.9□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 RSM22YKL155C 1887 nt1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 SDH6YDR379C-A 240 nt1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 SNU13YEL026W 381 nt1.89□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 snR14snR14 160 nt1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 IRA1YBR140C 9279 nt1.88□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 YGR164WYGR164W 336 nt1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 COA6YMR244C-A 315 nt1.87□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 MEC1YBR136W 7107 nt1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 NUP192YJL039C 5052 nt1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 BST1YFL025C 3090 nt1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 SWI4YER111C 3282 nt1.86□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 MDS3YGL197W 4464 nt1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 PRP42YDR235W 1635 nt1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 DNF3YMR162C 4971 nt1.85□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 MON2YNL297C 4911 nt1.84□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.84□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.84□□□□□ -2.11
GDE1Q02979 SET3YKR029C 2256 nt1.84□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 SMC1YFL008W 3678 nt1.82□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 NUP145YGL092W 3954 nt1.82□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 STO1YMR125W 2586 nt1.82□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 EAF1YDR359C 2949 nt1.81□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 CAT8YMR280C 4302 nt1.8□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.8□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 CHS1YNL192W 3396 nt1.79□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 APL3YBL037W 3078 nt1.79□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 COX5BYIL111W 456 nt1.78□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 SXM1YDR395W 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 PRP5YBR237W 2550 nt1.78□□□□□ -2.12
GDE1Q02979 NOP9YJL010C 2001 nt1.78□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 VPS15YBR097W 4365 nt1.77□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 SEC3YER008C 4011 nt1.77□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 CMC4YMR194C-B 222 nt1.77□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 WAR1YML076C 2835 nt1.77□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 EST2YLR318W 2655 nt1.76□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 MSN5YDR335W 3675 nt1.76□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.75□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.75□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 AZF1YOR113W 2745 nt1.75□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 YOR102WYOR102W 351 nt1.74□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 snR48snR48 113 nt1.74□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 TRM732YMR259C 4263 nt1.74□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 PMD1YER132C 5262 nt1.74□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 BFR2YDR299W 1605 nt1.73□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.73□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 YLL020CYLL020C 306 nt1.73□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 SSK2YNR031C 4740 nt1.73□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 MSH3YCR092C 3057 nt1.72□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 YLR282CYLR282C 342 nt1.72□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 UTP8YGR128C 2142 nt1.72□□□□□ -2.13
GDE1Q02979 RPL26BYGR034W 384 nt1.71□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 CDC31YOR257W 486 nt1.71□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 YBL053WYBL053W 375 nt1.7□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.7□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 YML002WYML002W 2214 nt1.7□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.69□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 NUP157YER105C 4176 nt1.69□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 PIK1YNL267W 3201 nt1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 HUG1YML058W-A 207 nt1.68□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 RPM2YML091C 3609 nt1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 FIG2YCR089W 4830 nt1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 NUP188YML103C 4968 nt1.67□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 SPC110YDR356W 2835 nt1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 STF2YGR008C 255 nt1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 YLR041WYLR041W 321 nt1.66□□□□□ -2.14
GDE1Q02979 YGL182CYGL182C 324 nt1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 LAA1YJL207C 6045 nt1.65□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 SEC21YNL287W 2808 nt1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 snR190snR190 190 nt1.64□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 ASE1YOR058C 2658 nt1.63□□□□□ -2.15
GDE1Q02979 CCH1YGR217W 6120 nt1.63□□□□□ -2.15
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