Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS1P54277 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS1P54277 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PMS1P54277 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PMS1P54277 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS1P54277 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS1P54277 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS1P54277 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PMS1P54277 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS1P54277 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms