Protein–RNA interactions for Protein: P40555

NAS2, Probable 26S proteasome regulatory subunit p27, yeastyeast

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NAS2P40555 COX5BYIL111W 456 nt0.47□□□□□ -2.33
NAS2P40555 CSN9YDR179C 489 nt0.46□□□□□ -2.34
NAS2P40555 HTB2YBL002W 396 nt0.46□□□□□ -2.34
NAS2P40555 SGF11YPL047W 300 nt0.46□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YPL225WYPL225W 441 nt0.46□□□□□ -2.34
NAS2P40555 BIL1YOR304C-A 231 nt0.45□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.45□□□□□ -2.34
NAS2P40555 MYO1YHR023W 5787 nt0.45□□□□□ -2.34
NAS2P40555 VIK1YPL253C 1944 nt0.44□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.44□□□□□ -2.34
NAS2P40555 BEM3YPL115C 3387 nt0.43□□□□□ -2.34
NAS2P40555 FMP27YLR454W 7887 nt0.43□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YMR160WYMR160W 2451 nt0.43□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.43□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YMR321CYMR321C 318 nt0.43□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.42□□□□□ -2.34
NAS2P40555 SBH1YER087C-B 249 nt0.42□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YJL120WYJL120W 324 nt0.42□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.42□□□□□ -2.34
NAS2P40555 TAR1YLR154W-C 375 nt0.42□□□□□ -2.34
NAS2P40555 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.4□□□□□ -2.35
NAS2P40555 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.4□□□□□ -2.35
NAS2P40555 LEE1YPL054W 906 nt0.4□□□□□ -2.35
NAS2P40555 RPL35AYDL191W 363 nt0.38□□□□□ -2.35
NAS2P40555 snR190snR190 190 nt0.38□□□□□ -2.35
NAS2P40555 YSP1YHR155W 3687 nt0.38□□□□□ -2.35
NAS2P40555 PRP42YDR235W 1635 nt0.38□□□□□ -2.35
NAS2P40555 OST4YDL232W 111 nt0.37□□□□□ -2.35
NAS2P40555 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.37□□□□□ -2.35
NAS2P40555 PAU12YGR294W 363 nt0.36□□□□□ -2.35
NAS2P40555 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.36□□□□□ -2.35
NAS2P40555 MLP2YIL149C 5040 nt0.36□□□□□ -2.35
NAS2P40555 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 CSE2YNR010W 450 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 ASE1YOR058C 2658 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 PRP5YBR237W 2550 nt0.35□□□□□ -2.35
NAS2P40555 YGR035CYGR035C 351 nt0.34□□□□□ -2.36
NAS2P40555 HAL9YOL089C 3093 nt0.33□□□□□ -2.36
NAS2P40555 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.33□□□□□ -2.36
NAS2P40555 YDR048CYDR048C 315 nt0.32□□□□□ -2.36
NAS2P40555 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.32□□□□□ -2.36
NAS2P40555 RPS27BYHR021C 249 nt0.31□□□□□ -2.36
NAS2P40555 YKL136WYKL136W 399 nt0.31□□□□□ -2.36
NAS2P40555 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.3□□□□□ -2.36
NAS2P40555 SSS1YDR086C 243 nt0.3□□□□□ -2.36
NAS2P40555 BIR1YJR089W 2865 nt0.28□□□□□ -2.36
NAS2P40555 ULP2YIL031W 3105 nt0.28□□□□□ -2.36
NAS2P40555 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.28□□□□□ -2.36
NAS2P40555 YDR157WYDR157W 402 nt0.27□□□□□ -2.37
NAS2P40555 Q0144Q0144 330 nt0.27□□□□□ -2.37
NAS2P40555 ABF2YMR072W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
NAS2P40555 TRS65YGR166W 1683 nt0.26□□□□□ -2.37
NAS2P40555 COG8YML071C 1824 nt0.26□□□□□ -2.37
NAS2P40555 NNF2YGR089W 2811 nt0.26□□□□□ -2.37
NAS2P40555 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.26□□□□□ -2.37
NAS2P40555 IQG1YPL242C 4488 nt0.25□□□□□ -2.37
NAS2P40555 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.24□□□□□ -2.37
NAS2P40555 YLR282CYLR282C 342 nt0.24□□□□□ -2.37
NAS2P40555 UTP20YBL004W 7482 nt0.24□□□□□ -2.37
NAS2P40555 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.22□□□□□ -2.37
NAS2P40555 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.22□□□□□ -2.37
NAS2P40555 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.22□□□□□ -2.37
NAS2P40555 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.21□□□□□ -2.38
NAS2P40555 QCR9YGR183C 201 nt0.21□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YOL014WYOL014W 375 nt0.21□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YOR345CYOR345C 351 nt0.21□□□□□ -2.38
NAS2P40555 AI1Q0050 2505 nt0.2□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.2□□□□□ -2.38
NAS2P40555 VAR1Q0140 1197 nt0.2□□□□□ -2.38
NAS2P40555 BLI1YKL061W 342 nt0.2□□□□□ -2.38
NAS2P40555 COY1YKL179C 2040 nt0.19□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.18□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YCR022CYCR022C 345 nt0.17□□□□□ -2.38
NAS2P40555 snR60snR60 104 nt0.17□□□□□ -2.38
NAS2P40555 RPS26AYGL189C 360 nt0.17□□□□□ -2.38
NAS2P40555 YPR092WYPR092W 306 nt0.17□□□□□ -2.38
NAS2P40555 ULI1YFR026C 510 nt0.15□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.15□□□□□ -2.39
NAS2P40555 ORC3YLL004W 1851 nt0.14□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.14□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YNL146WYNL146W 303 nt0.14□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.14□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.13□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.13□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.13□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.12□□□□□ -2.39
NAS2P40555 COX12YLR038C 252 nt0.12□□□□□ -2.39
NAS2P40555 NIP1YMR309C 2439 nt0.12□□□□□ -2.39
NAS2P40555 HTL1YCR020W-B 237 nt0.11□□□□□ -2.39
NAS2P40555 YIL032CYIL032C 357 nt0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.7 ms