Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHE2P36068 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.14□□□□□ -2.39
SHE2P36068 HMRA2YCR096C 360 nt0.13□□□□□ -2.39
SHE2P36068 RPS25BYLR333C 327 nt0.13□□□□□ -2.39
SHE2P36068 SEC8YPR055W 3198 nt0.12□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.12□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.12□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YJL120WYJL120W 324 nt0.12□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YAR029WYAR029W 225 nt0.12□□□□□ -2.39
SHE2P36068 snR190snR190 190 nt0.12□□□□□ -2.39
SHE2P36068 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.11□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.1□□□□□ -2.39
SHE2P36068 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
SHE2P36068 UTP20YBL004W 7482 nt0.1□□□□□ -2.39
SHE2P36068 RPS26AYGL189C 360 nt0.09□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YHR138CYHR138C 345 nt0.09□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.09□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.09□□□□□ -2.4
SHE2P36068 VPS20YMR077C 666 nt0.09□□□□□ -2.4
SHE2P36068 BIR1YJR089W 2865 nt0.09□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YPR092WYPR092W 306 nt0.08□□□□□ -2.4
SHE2P36068 AI1Q0050 2505 nt0.08□□□□□ -2.4
SHE2P36068 STF2YGR008C 255 nt0.07□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.07□□□□□ -2.4
SHE2P36068 RCO1YMR075W 2055 nt0.07□□□□□ -2.4
SHE2P36068 ESP1YGR098C 4893 nt0.06□□□□□ -2.4
SHE2P36068 SSS1YDR086C 243 nt0.06□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.06□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YNL146WYNL146W 303 nt0.06□□□□□ -2.4
SHE2P36068 NNF2YGR089W 2811 nt0.06□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.05□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.05□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 ULI1YFR026C 510 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 COX12YLR038C 252 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.03□□□□□ -2.4
SHE2P36068 HAL9YOL089C 3093 nt0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 HUG1YML058W-A 207 nt0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 PRM3YPL192C 402 nt0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 STE5YDR103W 2754 nt0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 COY1YKL179C 2040 nt0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 RPL35AYDL191W 363 nt0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YBR285WYBR285W 435 nt0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YER079WYER079W 633 nt0□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YLR282CYLR282C 342 nt0□□□□□ -2.41
SHE2P36068 MLP2YIL149C 5040 nt-0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YJL007CYJL007C 315 nt-0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YKL136WYKL136W 399 nt-0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YPL205CYPL205C 345 nt-0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 COG8YML071C 1824 nt-0.01□□□□□ -2.41
SHE2P36068 NIP1YMR309C 2439 nt-0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 MLP1YKR095W 5628 nt-0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YJR157WYJR157W 363 nt-0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 HTB2YBL002W 396 nt-0.02□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YAR053WYAR053W 297 nt-0.03□□□□□ -2.41
SHE2P36068 YDR048CYDR048C 315 nt-0.04□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.04□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YLR202CYLR202C 327 nt-0.04□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YCR022CYCR022C 345 nt-0.05□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.05□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.05□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YOR121CYOR121C 306 nt-0.05□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.06□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YEL073CYEL073C 324 nt-0.08□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YKL063CYKL063C 504 nt-0.08□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YKU70YMR284W 1809 nt-0.08□□□□□ -2.42
SHE2P36068 RPS27BYHR021C 249 nt-0.09□□□□□ -2.42
SHE2P36068 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.09□□□□□ -2.42
SHE2P36068 AGA2YGL032C 264 nt-0.1□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-0.1□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.11□□□□□ -2.43
SHE2P36068 BUL2YML111W 2763 nt-0.11□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YLR232WYLR232W 348 nt-0.12□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YOL014WYOL014W 375 nt-0.12□□□□□ -2.43
SHE2P36068 SOV1YMR066W 2697 nt-0.13□□□□□ -2.43
SHE2P36068 SNU13YEL026W 381 nt-0.14□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.14□□□□□ -2.43
SHE2P36068 snR60snR60 104 nt-0.15□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.15□□□□□ -2.43
SHE2P36068 BLI1YKL061W 342 nt-0.15□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.15□□□□□ -2.43
SHE2P36068 CSE2YNR010W 450 nt-0.15□□□□□ -2.43
SHE2P36068 YNL324WYNL324W 396 nt-0.16□□□□□ -2.44
SHE2P36068 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.16□□□□□ -2.44
SHE2P36068 THO2YNL139C 4794 nt-0.16□□□□□ -2.44
SHE2P36068 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.17□□□□□ -2.44
SHE2P36068 YDR366CYDR366C 399 nt-0.18□□□□□ -2.44
SHE2P36068 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.18□□□□□ -2.44
SHE2P36068 YLR041WYLR041W 321 nt-0.18□□□□□ -2.44
SHE2P36068 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.18□□□□□ -2.44
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