Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	OST4	YDL232W	111 nt		0.25	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YPL225W	YPL225W	441 nt		0.25	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YOR192C-B	YOR192C-B	5313 nt		0.25	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		0.24	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	PCC1	YKR095W-A	267 nt		0.24	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		0.24	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YPL068C	YPL068C	882 nt		0.24	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	PET111	YMR257C	2403 nt		0.24	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		0.23	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	CSN9	YDR179C	489 nt		0.23	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	MYO1	YHR023W	5787 nt		0.23	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	SEC8	YPR055W	3198 nt		0.22	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	HMRA2	YCR096C	360 nt		0.22	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		0.22	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	RPS25B	YLR333C	327 nt		0.22	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	BIR1	YJR089W	2865 nt		0.22	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	COX5B	YIL111W	456 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	YJL007C	YJL007C	315 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	YOR345C	YOR345C	351 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	SGF11	YPL047W	300 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	VIK1	YPL253C	1944 nt		0.21	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	PRP42	YDR235W	1635 nt		0.2	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	VPS20	YMR077C	666 nt		0.2	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	YMR321C	YMR321C	318 nt		0.2	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	IQG1	YPL242C	4488 nt		0.18	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.17	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	YAR029W	YAR029W	225 nt		0.16	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	snR190	snR190	190 nt		0.16	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	ORC3	YLL004W	1851 nt		0.16	□□□□□ -2.38
MRPS28	P21771	STE5	YDR103W	2754 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YER079W	YER079W	633 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	PRM3	YPL192C	402 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YPL205C	YPL205C	345 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	RCO1	YMR075W	2055 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	MLP2	YIL149C	5040 nt		0.15	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		0.14	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	MLP1	YKR095W	5628 nt		0.14	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		0.13	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YKL063C	YKL063C	504 nt		0.13	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		0.12	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	RPS26A	YGL189C	360 nt		0.12	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YHR138C	YHR138C	345 nt		0.12	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.11	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		0.11	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		0.11	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	SSS1	YDR086C	243 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	LEE1	YPL054W	906 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	YBR285W	YBR285W	435 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	BUL2	YML111W	2763 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	THO2	YNL139C	4794 nt		0.1	□□□□□ -2.39
MRPS28	P21771	RPL35A	YDL191W	363 nt		0.09	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YDR354C-A	YDR354C-A	144 nt		0.09	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YNL146W	YNL146W	303 nt		0.09	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	NNF2	YGR089W	2811 nt		0.09	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	AGA2	YGL032C	264 nt		0.08	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		0.08	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YLR202C	YLR202C	327 nt		0.08	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YOR121C	YOR121C	306 nt		0.08	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	NIP1	YMR309C	2439 nt		0.07	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YCR022C	YCR022C	345 nt		0.07	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	ULI1	YFR026C	510 nt		0.07	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	COG8	YML071C	1824 nt		0.07	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YJR157W	YJR157W	363 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	HTB2	YBL002W	396 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YPR092W	YPR092W	306 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	COY1	YKL179C	2040 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YAR053W	YAR053W	297 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YLR282C	YLR282C	342 nt		0.05	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	COX12	YLR038C	252 nt		0.04	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YNL324W	YNL324W	396 nt		0.04	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		0.03	□□□□□ -2.4
MRPS28	P21771	YKL136W	YKL136W	399 nt		0.02	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	Q0017	Q0017	162 nt		0.02	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	SOV1	YMR066W	2697 nt		0	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		0	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	RPS27B	YHR021C	249 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YDR048C	YDR048C	315 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YKU70	YMR284W	1809 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YLR041W	YLR041W	321 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
MRPS28	P21771	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	snR45	snR45	172 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	BIL1	YOR304C-A	231 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	YFL063W	YFL063W	456 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	YGR035C	YGR035C	351 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
MRPS28	P21771	SNU13	YEL026W	381 nt		-0.1	□□□□□ -2.43

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.4 ms