Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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