Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP3Q6Q6R5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms