Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YJL120WYJL120W 324 nt1.75□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.75□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 MYO2YOR326W 4725 nt1.75□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 RPL31AYDL075W 342 nt1.74□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 RPS25BYLR333C 327 nt1.74□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YOR345CYOR345C 351 nt1.74□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 snR52snR52 92 nt1.74□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 IRC20YLR247C 4671 nt1.74□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 PKH3YDR466W 2697 nt1.73□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 RTP1YMR185W 2946 nt1.73□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 ZIP1YDR285W 2628 nt1.73□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 ZIP2YGL249W 2115 nt1.73□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 RAD34YDR314C 2079 nt1.73□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 AGC1YPR021C 2709 nt1.73□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 NOC3YLR002C 1992 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 MCM10YIL150C 1716 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 ULI1YFR026C 510 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 ECM12YHR021W-A 456 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 COF1YLL050C 432 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YNL170WYNL170W 396 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 YBR174CYBR174C 315 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 REV3YPL167C 4515 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 ATG11YPR049C 3537 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 HIR3YJR140C 4947 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 TDA9YML081W 3756 nt1.72□□□□□ -2.13
UBX3Q12229 MSH5YDL154W 2706 nt1.71□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 IRE1YHR079C 3348 nt1.71□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 MAD1YGL086W 2250 nt1.7□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 SAS3YBL052C 2496 nt1.69□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 APL2YKL135C 2181 nt1.69□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 MSH6YDR097C 3729 nt1.69□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 LRE1YCL051W 1752 nt1.69□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 DCP2YNL118C 2913 nt1.68□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.68□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 LHS1YKL073W 2646 nt1.68□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 CTR9YOL145C 3234 nt1.67□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 PMP1YCR024C-A 123 nt1.67□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.67□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.67□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 MAK10YEL053C 2202 nt1.67□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 FAB1YFR019W 6837 nt1.67□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 AHC1YOR023C 1701 nt1.66□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 YBL053WYBL053W 375 nt1.66□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.66□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 PEP1YBL017C 4740 nt1.66□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 MLH3YPL164C 2148 nt1.66□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 PIG1YLR273C 1947 nt1.66□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 DGR2YKL121W 2559 nt1.65□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 MDS3YGL197W 4464 nt1.65□□□□□ -2.14
UBX3Q12229 YDL196WYDL196W 330 nt1.65□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 SDH6YDR379C-A 240 nt1.65□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YHR210CYHR210C 1026 nt1.65□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 RPL33BYOR234C 324 nt1.65□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 CFT1YDR301W 4074 nt1.65□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YLL007CYLL007C 1998 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 TBS1YBR150C 3285 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 COY1YKL179C 2040 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YOR019WYOR019W 2193 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 SAC3YDR159W 3906 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 HMI1YOL095C 2121 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YOR093CYOR093C 4947 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 FRK1YPL141C 2598 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YIR044CYIR044C 186 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 COA6YMR244C-A 315 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 SKI3YPR189W 4299 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 CUL3YGR003W 2235 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 CTF4YPR135W 2784 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YDR521WYDR521W 336 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YGR164WYGR164W 336 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 SPO24YPR036W-A 204 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 YBR206WYBR206W 324 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 FIG4YNL325C 2640 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 ALK1YGL021W 2283 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 DNF3YMR162C 4971 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 Q0143Q0143 153 nt1.59□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 PIP2YOR363C 2991 nt1.59□□□□□ -2.15
UBX3Q12229 ADR1YDR216W 3972 nt1.59□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 AIM44YPL158C 2277 nt1.59□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 UTP21YLR409C 2820 nt1.58□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 YEL073CYEL073C 324 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 COG4YPR105C 2586 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 IFH1YLR223C 3258 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 KCS1YDR017C 3153 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 PTP2YOR208W 2253 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 NCA2YPR155C 1851 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 PRP42YDR235W 1635 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 MON2YNL297C 4911 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 PKH2YOL100W 3246 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 SLD3YGL113W 2007 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 HAL9YOL089C 3093 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX3Q12229 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.54□□□□□ -2.16
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